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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003892`

染色体: Chr01 坐标: 57216925-57223532 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003892`
名称	SmilChr01G003892
描述	uncharacterized SmilChr01G003892
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	57216925 - 57223532 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997679`
GeneID	`130997679`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997679`
原始查询	`LOC130997679`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phosphoribosylformylglycinamidine synthase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5007958]; symbol=AT2G43235; hit=AT2G43235; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	phosphoribosylformylglycinamidine synthase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5007958]; symbol=AT2G43235; hit=AT2G43235; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G43235` (AT2G43235) phosphoribosylformylglycinamidine synthase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5007958] identity=39.6; qcov=0.938; evalue=1.9e-81; confidence=medium
Rice	`Os05g0299200` - identity=41; qcov=0.836; evalue=2.12e-64; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997679

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057779080.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.60000	`XP_057779080.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057779080.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779080.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779080.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:57217930`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B25,C35,C56,D7
`Chr1:57218438`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr1:57218462`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B104,B24
`Chr1:57220399`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,B82
`Chr1:57220405`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr1:57220677`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr1:57221381`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B104,B24
`Chr1:57221429`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr1:57222711`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C56
`Chr1:57222711`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C56
`Chr1:57222751`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr1:57222812`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009093146.1
GCCCTTAACGTGAAACAATTTCAATACCGATGATAACTGTAAACTCAAGCTCAAAAGGGAAACTTTTTCCTCCTCACCTGCAATTTTCCCAGGGACCGTCTGAATTTATATGATTTTGATTTAAAAAATTTGTATGCTTCCAACAATTTTATTTTCTCAGTAGGCGTAGGGCCACCCAGTTTCTCTCTCTATGTAACGTAATGAGCAGCTGCTACTCTCTCTCACTTGAGCCACTCATGTACCTCAGTTTCTCCGACCGC...

XM_057923097.1
AACGTGAAACAATTTCAATACCGATGATAACTGTAAACTCAAGCTCAAAAGGGAAACTTTTTCCTCCTCACCTGCAATTTTCCCAGGGACCGTCTGAATTTATATGATTTTGATTTAAAAAATTTGTATGCTTCCAACAATTTTATTTTCTCAGTAGGCGTAGGGCCACCCAGTTTCTCTCTCTATGTAACGTAATGAGCAGCTGCTACTCTCTCTCACTTGAGCCACTCATGTACCTCAGTTTCTCCGACCGCTGTCGT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130997679
ATGAGCAGCTGCTACTCTCTCTCACTTGAGCCACTCATGTACCTCAGTTTCTCCGACCGCTGTCGTTTCCGCCACGCCGTCGTCACCTCCGCCGCCCGCCGTCACCACCGCCGCCGCCTCCTCAAGTATTCCCCTAATCACCCGTCGACGCCTAGCCATCAACCCGCCATCTTCAAGCTCTCCGATGACACTCTCCAAATAACCCTAAAATCCCCTTCTAGTTCCCTTCAGAAGCTCGATACTAAACTCCATCAGTTCAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057779080.1
MSSCYSLSLEPLMYLSFSDRCRFRHAVVTSAARRHHRRRLLKYSPNHPSTPSHQPAIFKLSDDTLQITLKSPSSSLQKLDTKLHQFIDLGREAFDDLRTVVAVDGSTGGVVISCRRSTVEFFSALFVSSLVLVIVVRSLFRMRESGGEVLIYKRDRSLGGKEVVVGKREDSWLRSRTSTPLSSENADYYYQNKSNRRNASSRRRKVKLPQWWPQVVSQGPVEVENKEEYQRLANHLIQVIMDRKMNGEDISTNDIVQLRH...

XP_057779082.1
MSSCYSLSLEPLMYLSFSDRCRFRHAVVTSAARRHHRRRLLKYSPNHPSTPSHQPAIFKLSDDTLQITLKSPSSSLQKLDTKLHQFIDLGREAFDDLRTVVAVDGSTGGVVISCRRSTVEFFSALFVSSLVLVIVVRSLFRMRESGGEVLIYKRDRSLGGKEVVVGKREDSWLRSRTSTPLSSENADYYYQNKSNRRNASSRRRKVKLPQWWPQVVSQGPVEVENKEEYQRLANHLIQVIMDRKMNGEDISTNDIVQLRH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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