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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003123`

染色体: Chr08 坐标: 31553667-31558523 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003123`
名称	SmilChr08G003123
描述	dnaJ protein P58IPK homolog
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	31553667 - 31558523 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997713`
GeneID	`130997713`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997713`
原始查询	`LOC130997713`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dnaJ protein P58IPK homolog
产物	dnaJ protein P58IPK homolog
Arabidopsis	`AT5G03160` (P58IPK) DnaJ P58IPK-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831917] identity=72.4; qcov=0.893; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0195300` (OsDjC16) - identity=70.3; qcov=0.836; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005788 (endoplasmic reticulum lumen)
KEGG	smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00226 (DnaJ); PF13181 (TPR_8); PF13432 (TPR_16)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997713

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057779110.1`
2	Lipid droplet	脂滴	0.20000	`XP_057779110.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779110.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779110.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779110.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:31553837`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	13	A20,B11,B131,B136,B33,B4,B55,B82,C19,C3,C36,D4,D7
`Chr8:31554935`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B56,C27,C83
`Chr8:31554935`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,C27,C83
`Chr8:31554995`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B34,B88,C85
`Chr8:31555013`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B119
`Chr8:31555564`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B101,B28,B7,B80
`Chr8:31555892`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B96,D4
`Chr8:31556328`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B133,C22
`Chr8:31556368`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr8:31556406`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B21,B82,C48,C52
`Chr8:31556422`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B134,B74,C2,D7
`Chr8:31556643`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779110.1

512 aa

256

512

TPR_16

TPR_8

TPR_16

TPR_8

DnaJ

PF13432 TPR_16 98-150 aa PF13181 TPR_8 118-149 aa PF13432 TPR_16 169-220 aa PF13181 TPR_8 233-265 aa PF00226 DnaJ 404-467 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779110.1`	Pfam	`PF13432`	TPR_16	Repeat	98	150	4.1e-17	63.0	Tetratricopeptide repeat
`XP_057779110.1`	Pfam	`PF13181`	TPR_8	Repeat	118	149	5.3e-12	45.6	Tetratricopeptide repeat
`XP_057779110.1`	Pfam	`PF13432`	TPR_16	Repeat	169	220	4.1e-17	63.0	Tetratricopeptide repeat
`XP_057779110.1`	Pfam	`PF13181`	TPR_8	Repeat	233	265	5.3e-12	45.6	Tetratricopeptide repeat
`XP_057779110.1`	Pfam	`PF00226`	DnaJ	Domain	404	467	1e-25	90.3	DnaJ domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923127.1
AAATTAAAATTACAATATTTCATATGCTACTTAAAATTCTGGCTGGACAAGCATGTACCTATACTTATATCTCTGTTAGTTTCTTTTATTATAGATTTGTCATAAATATTGGAGGCTTCATCATCGAGGTGCAGATGGGGATGAAGCTCTGTGGCTTTGATTCAGTGGCGCGAATAGGCTTTGTCTACGCCGCATTGATTCTCAACTTTGTGTTTTGCTGCCAGCTTCTCCTCCTCCAACCGCTCGTTGCTGCAGATGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997713
ATGCTACTTAAAATTCTGGCTGGACAAGCATGTACCTATACTTATATCTCTGTTAGTTTCTTTTATTATAGATTTGTCATAAATATTGGAGGCTTCATCATCGAGGTGCAGATGGGGATGAAGCTCTGTGGCTTTGATTCAGTGGCGCGAATAGGCTTTGTCTACGCCGCATTGATTCTCAACTTTGTGTTTTGCTGCCAGCTTCTCCTCCTCCAACCGCTCGTTGCTGCAGATGGCCAAGCAGGTGGTGCTTCTCTCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779110.1
MLLKILAGQACTYTYISVSFFYYRFVINIGGFIIEVQMGMKLCGFDSVARIGFVYAALILNFVFCCQLLLLQPLVAADGQAGGASLFERVSQSVKVKKFSEALRDLNAAIEADPALSEAYWHRASILRQLCRYEESERSYKSFLEMKPGNSAAEKELSQLYQAQNALNSANDLFDSGDFTKALEYIYKVVLVFSPECFKAKLLKVRLLIAAKDYSKAISETGFILKEDENDLEALLLRGRAYYYLADHDIATRHYQKGLR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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