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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003142`

染色体: Chr08 坐标: 31825363-31826850 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003142`
名称	SmilChr08G003142
描述	aquaporin PIP2-4-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	31825363 - 31826850 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997731`
GeneID	`130997731`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997731`
原始查询	`LOC130997731`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aquaporin PIP2-4-like
产物	aquaporin PIP2-4-like
Arabidopsis	`AT5G60660` (PIP2;4) plasma membrane intrinsic protein 2;4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836187] identity=80.1; qcov=1; evalue=4.65e-168; confidence=high
Rice	`Os02g0629200` (OsPIP2) - identity=80.3; qcov=1.01; evalue=9.52e-170; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0015250 (water channel activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00230 (MIP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997731

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057779124.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779124.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779124.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779124.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779124.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:31825788`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr8:31825855`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr8:31825959`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr8:31826007`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr8:31826399`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,B33
`Chr8:31826432`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B13,C8,D7
`Chr8:31826481`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C38
`Chr8:31826481`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C38
`Chr8:31826485`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C38
`Chr8:31826485`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C38
`Chr8:31826489`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr8:31826600`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,A8,B33

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779124.1

286 aa

143

286

MIP

PF00230 MIP 35-265 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779124.1`	Pfam	`PF00230`	MIP	Family	35	265	3.1e-84	282.9	Major intrinsic protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923141.1
TGAAATAATAAGGCAAAATTACTAAAATGGGGCGGCAAAATTGAATCCAATCAATGATTCCAGCCGCAGTTGGGAGTTCTCCTCCTGGTATAAATAGCCCCCAAACCAAATCCCCATCAAACACACTCACTCATACTCATCATCATCTACAGCTCAACAAAGCACTAATCCCACTCCCAGCAATTTCGACACAGTTGTGAGGTAGACAAATCGAGATGACGAAGGATGTAGAGGTGGGCGGTCACGGTCACGGACACGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997731
ATGACGAAGGATGTAGAGGTGGGCGGTCACGGTCACGGACACGACTACGGCGCAAAGGACTACCAAGACCCGCCGCCGGCGCCGCTAATCGACATGGAGGAGTTGGGCAAATGGTCACTCTACAGGGCGGCCATCGCCGAATTCATCGCAACCCTCTTGTTCCTCTACGTCACCGTGCTCACCGTCATCGGCTACAAGAGCCAGAGCGCCGCCGACCAGTGCGGCGGCGTCGGCATCCTCGGCATCGCCTGGGCTTTCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779124.1
MTKDVEVGGHGHGHDYGAKDYQDPPPAPLIDMEELGKWSLYRAAIAEFIATLLFLYVTVLTVIGYKSQSAADQCGGVGILGIAWAFGGMIFVLVYCTAGISGGHINPAVTFGLLLARKVSLVRALLYIVAQCLGAICGCGLVKAFQKTYYVQYGGGANELSDGYSTGTGVAAEIIGTFVLVYTVFSATDPKRNARDSHVPVLAPLPIGFAVFMVHLATIPVTGTGINPARSFGAAVIYGKDKAWDDQWIFWVGPLVGAAI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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