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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003143`

染色体: Chr08 坐标: 31845503-31846380 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003143`
名称	SmilChr08G003143
描述	60S ribosomal protein L12
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	31845503 - 31846380 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997732`
GeneID	`130997732`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997732`
原始查询	`LOC130997732`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	60S ribosomal protein L12
产物	60S ribosomal protein L12
Arabidopsis	`AT5G60670` (AT5G60670) Ribosomal protein L11 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836188] identity=90.2; qcov=0.988; evalue=4.38e-107; confidence=high
Rice	`Os02g0699600` - identity=91.5; qcov=0.988; evalue=1.7e-108; confidence=high
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0022625 (cytosolic large ribosomal subunit); GO:0070180 (large ribosomal subunit rRNA binding)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00298 (Ribosomal_L11); PF03946 (Ribosomal_L11_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997732

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057779125.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057779125.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779125.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779125.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779125.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:31845737`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B40,B60
`Chr8:31845751`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B124,B40,B60
`Chr8:31845751`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B40,B60
`Chr8:31845878`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B40,B60
`Chr8:31845924`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	75	A1,A16,A18,A2,A22,A23,A6,B102,B104,B107,B108,B109,B114,B119,B12,B123,B125,B127,B135,B14,B140,B26,B27,B29,B33,B34,B35,B37,B38,B4,B40,B43,B48,B51,B54,B55,B56,B74,B75,B77,B80,B81,B82,B84,B91,B95,C18,C21,C23,C29,C31,C33,C34,C35,C37,C4,C42,C54,C55,C58,C61,C63,C68,C73,C76,C8,C81,C84,C85,C86,C9,D3,D4,D8,D9
`Chr8:31845938`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:31845977`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B113,B132,D11
`Chr8:31845983`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr8:31845984`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,D10
`Chr8:31846015`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C48
`Chr8:31846015`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr8:31846139`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B33,C32,C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779125.1

166 aa

166

Ribosomal_L11_N

Ribosomal_L11

PF03946 Ribosomal_L11_N 13-70 aa PF00298 Ribosomal_L11 75-144 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779125.1`	Pfam	`PF03946`	Ribosomal_L11_N	Domain	13	70	6.3e-20	71.4	Ribosomal protein L11, N-terminal domain
`XP_057779125.1`	Pfam	`PF00298`	Ribosomal_L11	Domain	75	144	1.1e-20	74.5	Ribosomal protein L11, RNA binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923142.1
GGAGACTCCGGTAGGCCCAAACCAACGAAAAAGGGCAAAATCGTCACTTAAGCACATCATCTCCGCAAAACCCTAGCTAAATATAACTCAAATCCCAAACAAAGCAAACACCTATTATTCGCCTCCTCCTCCACAAAACCCTACACCCAGCCGCCGCCTGATCCGTCAAAATGCCGCCGAAGTTCGACCCTTCCCAAGTAGTCGACGTCTACGTGAGGGTAACCGGCGGCGAAGTCGGCGCGGCCTCTTCCCTGGCCCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997732
ATGCCGCCGAAGTTCGACCCTTCCCAAGTAGTCGACGTCTACGTGAGGGTAACCGGCGGCGAAGTCGGCGCGGCCTCTTCCCTGGCCCCCAAAATCGGTCCTCTAGGTCTCTCCCCAAAGAAGATCGGTGAGGACATCGCCAAGGAAACCGCCAAGGACTGGAAGGGCCTCCGCGTTACCGTCAAGCTCACCGTCCAGAACCGTCAGGCCAAGGTCACCGTCGTCCCCTCTGCCGCCGCCCTGGTCATCAAGGCGCTCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779125.1
MPPKFDPSQVVDVYVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKDWKGLRVTVKLTVQNRQAKVTVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIKHNGNISLDDVIEIAKVMSPRSMAKDLSGTVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEITDGDVEVPLD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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