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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003158`

染色体: Chr08 坐标: 32134977-32137163 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003158`
名称	SmilChr08G003158
描述	29 kDa ribonucleoprotein A, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	32134977 - 32137163 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997744`
GeneID	`130997744`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997744`
原始查询	`LOC130997744`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	29 kDa ribonucleoprotein A, chloroplastic-like
产物	29 kDa ribonucleoprotein A%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT2G37220` (AT2G37220) RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818299] identity=58.4; qcov=0.836; evalue=5.39e-83; confidence=high
Rice	`Os07g0631900` (P0519E12.113) - identity=61.5; qcov=0.71; evalue=2.92e-81; confidence=high
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005829 (cytosol)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997744

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057779138.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057779138.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779138.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779138.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779138.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:32135182`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr8:32135193`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C4
`Chr8:32135193`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C4
`Chr8:32135203`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B39
`Chr8:32135205`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr8:32135207`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C77
`Chr8:32136291`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779138.1

293 aa

146

293

RRM_1

PF00076 RRM_1 88-158 aa PF00076 RRM_1 215-285 aa

XP_057779139.1

293 aa

146

293

RRM_1

PF00076 RRM_1 88-158 aa PF00076 RRM_1 215-285 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779138.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	88	158	6.2e-46	154.9	RNA recognition motif
`XP_057779138.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	215	285	6.2e-46	154.9	RNA recognition motif
`XP_057779139.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	88	158	6.2e-46	154.9	RNA recognition motif
`XP_057779139.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	215	285	6.2e-46	154.9	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923156.1
ACGGCGGAGCCGGCAAGTTGCAGCTCCCTCAATAAACCTACACCTTTTTATCGATAAATATCCGTCTCGGCGCCCTCTCTCTCTCTACTCCAAAGCCTGTTTTCATTTGTTAGAGGAGAAACCCCAAAACCTTATCTCTACACAACACGCAGTAGCAATGGCTGCTTCTACCCATTTCTTATCCTTAGCCCCACGCACCCTCTCCCTGCACCACTCCAACTCCTCCGCCGCCGCTTCCGCTCCTTCTCTCTTCACGCCGT...

XM_057923155.1
AGCCGGCAAGTTGCAGCTCCCTCAATAAACCTACACCTTTTTATCGATAAATATCCGTCTCGGCGCCCTCTCTCTCTCTACTCCAAAGCCTGTTTTCATTTGTTAGAGGAGAAACCCCAAAACCTTATCTCTACACAACACGCAGTAGCAATGGCTGCTTCTACCCATTTCTTATCCTTAGCCCCACGCACCCTCTCCCTGCACCACTCCAACTCCTCCGCCGCCGCTTCCGCTCCTTCTCTCTTCACGCCGTCTTCCAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130997744
ATGGCTGCTTCTACCCATTTCTTATCCTTAGCCCCACGCACCCTCTCCCTGCACCACTCCAACTCCTCCGCCGCCGCTTCCGCTCCTTCTCTCTTCACGCCGTCTTCCATCAAAATCCTGCCTAAACTCGTCCTCGCTCTCTCATCCGTCTCCAGCCGCGCTTCCAACTTTGTAAGGAACGTCGCGCTCTCGTCGGACGTGGAGGAGGACGAAACCCCCTACGTCGGCGGCGCGGAGCGGGAGGAGTCTCCGGATTTGAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057779138.1
MAASTHFLSLAPRTLSLHHSNSSAAASAPSLFTPSSIKILPKLVLALSSVSSRASNFVRNVALSSDVEEDETPYVGGAEREESPDLKLFVGNLPFSVDSAALADLFQQAGSVEEVEVIYDKATGRSRGFAFVVMSTIEEAEAAVEQFNGYEIEGRALRVNSGPPPPKRESSFGGRDSSFGGSRGRERSSYGNNSFGGPRGGGSRERSSFGNANKIYVGNLSWDVDNLALESVFSEHGNVQEARVVYDRENGRSRGFGFVT...

XP_057779139.1
MAASTHFLSLAPRTLSLHHSNSSAAASAPSLFTPSSIKILPKLVLALSSVSSRASNFVRNVALSSDVEEDETPYVGGAEREESPDLKLFVGNLPFSVDSAALADLFQQAGSVEEVEVIYDKATGRSRGFAFVVMSTIEEAEAAVEQFNGYEIEGRALRVNSGPPPPKRESSFGGRDSSFGGSRGRERSSYGNNSFGGPRGGGSRERSSFGNANKIYVGNLSWDVDNLALESVFSEHGNVQEARVVYDRENGRSRGFGFVT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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