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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003162`

染色体: Chr08 坐标: 32221592-32224798 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003162`
名称	SmilChr08G003162
描述	cytokinin riboside 5'-monophosphate phosphoribohydrolase LOG3
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	32221592 - 32224798 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997747`
GeneID	`130997747`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997747`
原始查询	`LOC130997747`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytokinin riboside 5'-monophosphate phosphoribohydrolase LOG3
产物	cytokinin riboside 5'-monophosphate phosphoribohydrolase LOG3
Arabidopsis	`AT2G37210` (LOG3) lysine decarboxylase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818298] identity=89.2; qcov=0.969; evalue=1.29e-102; confidence=high
Rice	`Os02g0628000` (LOGL2) - identity=82.7; qcov=1; evalue=2.56e-99; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0005829 (cytosol); GO:0009691 (cytokinin biosynthetic process); GO:0016799 (hydrolase activity, hydrolyzing N-glycosyl compounds)
KEGG	-
Pfam	PF03641 (Lysine_decarbox); PF18306 (LDcluster4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997747

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779141.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057779142.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779141.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779141.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779141.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:32222743`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr8:32222800`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D11
`Chr8:32224498`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779141.1

218 aa

109

218

LDcluster4

Lysine_decarbox

PF18306 LDcluster4 20-145 aa PF03641 Lysine_decarbox 57-187 aa

XP_057779142.1

162 aa

162

LDcluster4

Lysine_decarbox

PF18306 LDcluster4 1-92 aa PF03641 Lysine_decarbox 1-131 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779141.1`	Pfam	`PF18306`	LDcluster4	Family	20	145	8.1e-15	55.5	SLOG cluster4 family
`XP_057779141.1`	Pfam	`PF03641`	Lysine_decarbox	Family	57	187	2.2e-50	170.9	Possible lysine decarboxylase
`XP_057779142.1`	Pfam	`PF18306`	LDcluster4	Family	1	92	1.2e-06	29.0	SLOG cluster4 family
`XP_057779142.1`	Pfam	`PF03641`	Lysine_decarbox	Family	1	131	9.4e-51	172.1	Possible lysine decarboxylase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923158.1
TTATTGGTGAAGAGCCAAGATTGGGCAAGCAAAGAGTTCTCTAGTTGATGCCTTAGTGCTTCCATTCTATCATTGCACAAACTCTCTGTCTCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAAGTAATAGACATTACCTAGCATATAGGCATTATATAGTTTGTGCCCACAAACTAGTTAGGTCCATAAACAGGGGAGACTAATAGAAGCAAGATTCTTATTTTATTCCTAGTTGTGACCTACGTTAGGAGATAAAAGACAAATA...

XM_057923159.1
TCCTGGCTCAGTACAAACTATGAAAACGTGGCCCAATAATCCTGTGTTTGTTGGTTTCAAGGAACATTGATTTGGTCTATGGGGGTGGCAGCATAGGCCTGATGGGTTTGGTCTCACAAGCAGTTCATGATGGCGGTCGGCATGTCATTGGGGTGATTCCCAAGACTCTCATGCCTCGAGAGCTAACTGGGGAAACAGTAGGAGAAGTGAAAGCTGTAGCAGATATGCACCAAAGGAAAGCTGAGATGGCGAAGCATTCT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130997747
ATGGAGAGAGATAGTGAAATGAAATCATCAAGATTCAAGAGGGTTTGTGTTTTCTGTGGCAGTAGCCAAGGCAAGAAGGCTAGCTACCAAGAAGCTGCTATTGAACTTGGCAAAGTTCTGGTTTCAAGGAACATTGATTTGGTCTATGGGGGTGGCAGCATAGGCCTGATGGGTTTGGTCTCACAAGCAGTTCATGATGGCGGTCGGCATGTCATTGGGGTGATTCCCAAGACTCTCATGCCTCGAGAGCTAACTGGGGA...

LOC130997747
ATGGGTTTGGTCTCACAAGCAGTTCATGATGGCGGTCGGCATGTCATTGGGGTGATTCCCAAGACTCTCATGCCTCGAGAGCTAACTGGGGAAACAGTAGGAGAAGTGAAAGCTGTAGCAGATATGCACCAAAGGAAAGCTGAGATGGCGAAGCATTCTGACGCTTTTATTGCCTTACCAGGTGGCTATGGAACTTTGGAGGAATTGCTTGAAGTTATAACTTGGGCTCAACTCGGCATCCATGATAAGCCGGTAGGATT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057779141.1
MERDSEMKSSRFKRVCVFCGSSQGKKASYQEAAIELGKVLVSRNIDLVYGGGSIGLMGLVSQAVHDGGRHVIGVIPKTLMPRELTGETVGEVKAVADMHQRKAEMAKHSDAFIALPGGYGTLEELLEVITWAQLGIHDKPVGLLNVDEYYDSLLSFIDKAVEEGFISPNARHIIVSAPTPKELVKKLEEYVPRHERVASKLSWETEQLGYTQDYDLSR

XP_057779142.1
MGLVSQAVHDGGRHVIGVIPKTLMPRELTGETVGEVKAVADMHQRKAEMAKHSDAFIALPGGYGTLEELLEVITWAQLGIHDKPVGLLNVDEYYDSLLSFIDKAVEEGFISPNARHIIVSAPTPKELVKKLEEYVPRHERVASKLSWETEQLGYTQDYDLSR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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