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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003164`

染色体: Chr08 坐标: 32269404-32273174 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003164`
名称	SmilChr08G003164
描述	auxin response factor 18-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	32269404 - 32273174 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997748`
GeneID	`130997748`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997748`
原始查询	`LOC130997748`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	auxin response factor 18-like
产物	auxin response factor 18-like
Arabidopsis	`AT4G30080` (ARF16) auxin response factor 16 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829131] identity=59.9; qcov=0.964; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0685700` (OsARF10) - identity=60.8; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0005515 (protein binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0009725 (response to hormone)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02362 (B3); PF06507 (ARF_AD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997748

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779143.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779143.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779143.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779143.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057779143.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:32270708`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr8:32270786`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B6
`Chr8:32270786`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B6
`Chr8:32270789`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B6
`Chr8:32270789`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B6
`Chr8:32271050`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B18,B42,B43,C37,C57
`Chr8:32271137`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,C39
`Chr8:32271755`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr8:32271811`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B97,C73
`Chr8:32272254`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	67	A16,A18,A20,A4,B101,B106,B111,B112,B115,B117,B12,B122,B129,B13,B132,B134,B137,B14,B17,B2,B21,B30,B37,B50,B52,B60,B63,B65,B69,B74,B75,B76,B8,B82,B84,B86,B88,B9,B93,B97,B98,B99,C1,C16,C17,C2,C26,C28,C29,C30,C34,C38,C41,C48,C51,C57,C64,C66,C72,C74,C76,C8,C80,C87,D1,D7,D8
`Chr8:32272336`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B4,C36,C46
`Chr8:32272351`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B18,C37,C57

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779143.1

704 aa

352

704

ARF_AD

PF02362 B3 142-243 aa PF06507 ARF_AD 327-410 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779143.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	142	243	9e-24	84.0	B3 DNA binding domain
`XP_057779143.1`	Pfam	`PF06507`	ARF_AD	Domain	327	410	2.6e-34	117.7	Auxin response factor ancillary domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923160.1
CAAATACATATACAATTACATATATATATATAGAGAGAGAAAGTAGTTGTACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATACGTGTGAATGGAGTTGAGTATGAAATATGGAAGAATGAAAGAGGGGGGGTTTATTAAGTAAAAGCAAAAAAATCCGGTTCTCGTCTATTCTGTTTTCTGTCAGGACTTTTGCCGTCTTTAACTAAATCCGTTTTCGCTTTATGCTTCATTTCTTTTTTTTGTTTTTTTCTCTGAGTTAATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997748
ATGCGATTCTGTCTGAGAAATCTGGCTCTTGGGTTTGTGGCAGCAAATGATATAAAATTGTGGATTGAAATGATTACCTTTATGGAATCGAAAGAGAAAATGAAAGAAACAGAGAGATGTTTGGATTCTCAATTATGGCATGCCTGCGCCGGCAGCATGGTGCAAATGCCATCCGTGAATTCCAAGGTGTTTTACTTCCCACAGGGCCACTCTGAGCACAGCTCTGGGAATGTTGATTTTAGGAGCTGCCCGAGAACTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779143.1
MRFCLRNLALGFVAANDIKLWIEMITFMESKEKMKETERCLDSQLWHACAGSMVQMPSVNSKVFYFPQGHSEHSSGNVDFRSCPRTPAYIACRVSSISFMADPDTDEVFAKMRLAPAGGKDVDDDGAVGISGSENQEKPTSFAKTLTQSDANNGGGFSVPRYCAETIFPRLDYSADPPVQTILAKDVHGDTWKFRHIYRGTPRRHLLTTGWSTFVNHKKLVAGDSIVFMRAENGDLCVGIRRAKRGIAGGPEISTGWNPT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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