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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003178`

染色体: Chr08 坐标: 32509959-32512632 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003178`
名称	SmilChr08G003178
描述	transport protein particle 20 kDa subunit-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	32509959 - 32512632 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997757`
GeneID	`130997757`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997757`
原始查询	`LOC130997757`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transport protein particle 20 kDa subunit-like
产物	transport protein particle 20 kDa subunit-like
Arabidopsis	`AT1G80500` (AT1G80500) SNARE-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844389] identity=85.7; qcov=0.905; evalue=9.13e-67; confidence=high
Rice	`Os02g0613600` - identity=83.8; qcov=0.905; evalue=4.63e-66; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006888 (endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport); GO:0030008 (TRAPP complex)
KEGG	-
Pfam	PF04628 (Sedlin_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997757

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057779152.1`
2	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.60000	`XP_057779152.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057779154.1`
4	Vesicle	囊泡	0.60000	`XP_057779152.1`
5	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.40000	`XP_057779152.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:32510219`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B130
`Chr8:32510617`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,B16
`Chr8:32512361`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr8:32512379`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	B103,B107,B127,B140,B29
`Chr8:32512379`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	5	B103,B107,B127,B140,B29
`Chr8:32512384`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr8:32512385`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779152.1

135 aa

135

Sedlin_N

PF04628 Sedlin_N 9-133 aa

XP_057779153.1

128 aa

128

Sedlin_N

PF04628 Sedlin_N 9-126 aa

XP_057779154.1

116 aa

116

Sedlin_N

PF04628 Sedlin_N 9-112 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779152.1`	Pfam	`PF04628`	Sedlin_N	Family	9	133	1.2e-43	149.0	Sedlin
`XP_057779153.1`	Pfam	`PF04628`	Sedlin_N	Family	9	126	3.5e-34	118.4	Sedlin
`XP_057779154.1`	Pfam	`PF04628`	Sedlin_N	Family	9	112	2.6e-33	115.6	Sedlin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923171.1
GGTTTAACGTTTCGTTGGGCTGAAACATCACACATGAAATCTGAATATATGAAGAAGATATGAACTTCTGTTCTACTATTTCCCAATTCAATTGCGTAAGTTTTGAAGTTTCTAGCAACGATTTCAAATTAAACTATTGATCGCGAATCACTGAGGAATTAGGCCAAAGAGGAGTGGGGGAGTTCAATGGCGAGTACTGCGTGCTTTATGATTGTCAGCAAAAATGACATTCCGATTTACGAAGCTGAAGTTGGTACCGT...

XM_057923169.1
GGTTTAACGTTTCGTTGGGCTGAAACATCACACATGAAATCTGAATATATGAAGAAGATATGAACTTCTGTTCTACTATTTCCCAATTCAATTGCGTAAGTTTTGAAGTTTCTAGCAACGATTTCAAATTAAACTATTGATCGCGAATCACTGAGGAATTAGGCCAAAGAGGAGTGGGGGAGTTCAATGGCGAGTACTGCGTGCTTTATGATTGTCAGCAAAAATGACATTCCGATTTACGAAGCTGAAGTTGGTACCGT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130997757
ATGGCGAGTACTGCGTGCTTTATGATTGTCAGCAAAAATGACATTCCGATTTACGAAGCTGAAGTTGGTACCGTCCCCAAAAAAGAGGATGCTGCTCATCAGCACCAGTTCATATTACATGCCGCTTTAGACATTGTTCAGGACATGGCGTGGACTACGAGTGCTATGTTTCTAAAAGCAATCGACAGATTCAATGACTTGGTGGTGTCCGTTTACGTGACTGCTGGTCATACTCGACTGATGTTGCTTCATGATTCTCG...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057779152.1
MASTACFMIVSKNDIPIYEAEVGTVPKKEDAAHQHQFILHAALDIVQDMAWTTSAMFLKAIDRFNDLVVSVYVTAGHTRLMLLHDSRNDDGIKSFFQEVHELYIKTLLNPLYLPGSRITSSHFDTKVRALARKYL

XP_057779153.1
MASTACFMIVSKNDIPIYEAEVGTVPKKEDAAHQHQFILHAALDIVQDMAWTTSAMFLKAIDRFNDLVVSVYVTAGHTRLMLLHDSRNDDGIKSFFQETLLNPLYLPGSRITSSHFDTKVRALARKYL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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