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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003179`

染色体: Chr08 坐标: 32513291-32514371 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003179`
名称	SmilChr08G003179
描述	transcription factor TCP11-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	32513291 - 32514371 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997759`
GeneID	`130997759`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997759`
原始查询	`LOC130997759`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor TCP11-like
产物	transcription factor TCP11-like
Arabidopsis	`AT2G37000` (AT2G37000) TCP family transcription factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818274] identity=57.5; qcov=0.717; evalue=1.87e-45; confidence=medium
Rice	`Os01g0924400` (OsTCP6) - identity=71.4; qcov=0.412; evalue=7.09e-36; confidence=low
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF03634 (TCP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997759

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779162.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779162.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779162.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779162.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057779162.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:32514016`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B115,B60,C80
`Chr8:32514033`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr8:32514046`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr8:32514098`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B121,B123,B79
`Chr8:32514149`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	114	A10,A13,A16,A19,A2,A22,A23,A24,A25,A3,A4,B100,B101,B102,B105,B11,B112,B113,B118,B120,B122,B124,B125,B127,B129,B131,B134,B135,B136,B137,B139,B14,B20,B22,B25,B26,B27,B28,B29,B30,B38,B39,B4,B40,B45,B51,B54,B55,B6,B61,B63,B64,B65,B66,B67,B68,B69,B7,B76,B8,B80,B81,B83,B87,B88,B9,B90,B91,B92,B93,B95,B97,C15,C16,C17,C21,C25,C26,C27,C3,C30,C31,C33,C34,C35,C36,C38,C44,C46,C47,C5,C55,C57,C59,C6,C62,C63,C64,C65,C67,C7,C71,C74,C75,C77,C78,C79,C81,C87,C9,D1,D2,D7,D9
`Chr8:32514150`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B77,C51
`Chr8:32514150`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B77,C51
`Chr8:32514172`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779162.1

187 aa

187

TCP

PF03634 TCP 41-111 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779162.1`	Pfam	`PF03634`	TCP	Family	41	111	2.9e-26	93.6	TCP family transcription factor

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923179.1
TCGTCAATTATCAACTATGTGTGGGACCATCTTTATCACTCTATGTGGATGCCTGACATTTGCGTTCTTGGTACAAGTACAACAAACACAGACATCATAATTGTTTCTTTGCTTTTTGTTATGGCATTGATTTTTCAACTAGTTATATACGGCGGTGCGTACAAAACGGTTAATAATATTGAAAAATCTGATTTGGCTATCCTTTAAAAATAAATAACACAAGCGAAGTCGCATATGAAATATTGAAATGAAATTTCGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997759
ATGCCTTCTTCTTCTTCGGATATGCTTCCTCACCTCGTCTCTTCTCCCCACCTCGCCCACGCCGACGACGCCCCCAAACCTATCACCGCACTCTCTATAACCAAGGCCCGCCGCCACTCCTCCAGTAAAGATCGCCACACCAAGGTTAACGGCCGCGGCCGCCGCGTGCGGATGCCGGCGCTCTGCGCCGCCCGCGTATTCCAGCTCACTCGAGAACTCGGCCACCGCACCGACGGAGAGACCATAGAGTGGCTCCTCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779162.1
MPSSSSDMLPHLVSSPHLAHADDAPKPITALSITKARRHSSSKDRHTKVNGRGRRVRMPALCAARVFQLTRELGHRTDGETIEWLLRHAEPSIIAATGTGTVPAEAVSTSSGSLLPSRDAATTALGVPPPPPSCRLDLCQPLALPPPPPNGVEFIPNGYGHMPFTALLLQPATVEEEKQSELGGDHE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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