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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003898`

染色体: Chr01 坐标: 57254068-57260371 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003898`
名称	SmilChr01G003898
描述	protein NLP9-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	57254068 - 57260371 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997768`
GeneID	`130997768`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997768`
原始查询	`LOC130997768`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein NLP9-like
产物	protein NLP9-like
Arabidopsis	`AT3G59580` (AT3G59580) Plant regulator RWP-RK family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825127] identity=47.7; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0495800` - identity=54.5; qcov=0.537; evalue=0; confidence=medium
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00564 (PB1); PF02042 (RWP-RK); PF22922 (GAF_NLP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997768

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779180.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779180.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779180.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779180.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057779180.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:57254772`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr1:57254981`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,B5,B95
`Chr1:57255077`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,B4,B55,B76
`Chr1:57255188`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,B14
`Chr1:57256286`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B96,C25,D7
`Chr1:57256374`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr1:57257105`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B94,C16
`Chr1:57257109`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B94,C26
`Chr1:57258082`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B115,C31
`Chr1:57258342`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr1:57258593`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,D7
`Chr1:57258657`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779180.1

1012 aa

506

1012

GAF_NLP

RWP-RK

PB1

PF22922 GAF_NLP 330-512 aa PF02042 RWP-RK 594-664 aa PF00564 PB1 913-993 aa

XP_057779185.1

1004 aa

502

1004

GAF_NLP

RWP-RK

PB1

PF22922 GAF_NLP 330-512 aa PF02042 RWP-RK 586-656 aa PF00564 PB1 905-985 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779180.1`	Pfam	`PF22922`	GAF_NLP	Domain	330	512	6.2e-84	280.5	NLP protein GAF domain
`XP_057779180.1`	Pfam	`PF02042`	RWP-RK	Domain	594	664	2.6e-26	92.3	RWP-RK domain
`XP_057779180.1`	Pfam	`PF00564`	PB1	Domain	913	993	2.5e-19	69.7	PB1 domain
`XP_057779185.1`	Pfam	`PF22922`	GAF_NLP	Domain	330	512	6e-84	280.6	NLP protein GAF domain
`XP_057779185.1`	Pfam	`PF02042`	RWP-RK	Domain	586	656	2.6e-26	92.3	RWP-RK domain
`XP_057779185.1`	Pfam	`PF00564`	PB1	Domain	905	985	3.2e-19	69.4	PB1 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923197.1
GTTGCAAATTGTTATAAACTAAAAAATCACATACAAAGTCAAAAAAAGAGCAAAGCCGCAAGCAGCCACAGCCGTTGTTCTCCACTGCTCCACCGCAGCTGCCTCCGCCGTAGGTTCATCTCGCTGTTTATTTCTGCCTCAACATCTCTAAATTTTTAAGGTTTCCAGTCTTTTGGACAACTGGATTCACAAAGGCTTGTTTCAAAATATCTAGCCAAAAGTGTAACCTAGGTTAATATGATACGAAGTGGACACTTTAT...

XM_057923202.1
TGCAAATTGTTATAAACTAAAAAATCACATACAAAGTCAAAAAAAGAGCAAAGCCGCAAGCAGCCACAGCCGTTGTTCTCCACTGCTCCACCGCAGCTGCCTCCGCCGTAGGTTCATCTCGCTGTTTATTTCTGCCTCAACATCTCTAAATTTTTAAGGTTTCCAGTCTTTTGGACAACTGGATTCACAAAGGCTTGTTTCAAAATATCTAGCCAAAAGTGTAACCTAGGTTAATATGATACGAAGTGGACACTTTATAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130997768
ATGGAGTACCCCTTTTCCAGTTTGGAAAAAGGTAACGAGTTTCCATTTGTACCAAGGAACGGGGTGGGGGATATGGCTGCAAGGTCAACGGATAACAGTGTGCAGGGCTCAAATTTGGAGGACTCGTTTGGTAATGTAGTAGAACTGATGAATTTTGATACATACGCTGGATGGTGCAGCAGTCCCAGCAATTTGGTTGACCAGATGTTTCCCTCCTTTTCAAATCTCTCGCCTCTTGACGGATTGAACTTCACACAACA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057779180.1
MEYPFSSLEKGNEFPFVPRNGVGDMAARSTDNSVQGSNLEDSFGNVVELMNFDTYAGWCSSPSNLVDQMFPSFSNLSPLDGLNFTQQHNSGISILDSDVNGSSSMNEDKVMLHNMDYQIPFATSPVDDGFSLTEMRDRSTKRKNLIGDVGHSVIPRPPIQSLSEKMLRALNLFKEWSGGGILAQVWVPMKNGDHYVLSTSEQPYLLDQTLSGYREVSRAFTFAAESKAGSFSGLPSRVFASRIPEWTSNITYYNKAEYHR...

XP_057779185.1
MEYPFSSLEKGNEFPFVPRNGVGDMAARSTDNSVQGSNLEDSFGNVVELMNFDTYAGWCSSPSNLVDQMFPSFSNLSPLDGLNFTQQHNSGISILDSDVNGSSSMNEDKVMLHNMDYQIPFATSPVDDGFSLTEMRDRSTKRKNLIGDVGHSVIPRPPIQSLSEKMLRALNLFKEWSGGGILAQVWVPMKNGDHYVLSTSEQPYLLDQTLSGYREVSRAFTFAAESKAGSFSGLPSRVFASRIPEWTSNITYYNKAEYHR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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