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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003902`

染色体: Chr01 坐标: 57298614-57300448 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003902`
名称	SmilChr01G003902
描述	amino acid transporter AVT1H-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	57298614 - 57300448 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997806`
GeneID	`130997806`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997806`
原始查询	`LOC130997806`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	amino acid transporter AVT1H-like
产物	amino acid transporter AVT1H-like
Arabidopsis	`AT5G16740` (AT5G16740) Transmembrane amino acid transporter family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831537] identity=61.1; qcov=0.964; evalue=3.82e-171; confidence=high
Rice	`Os11g0298000` (OsATL8) - identity=62.5; qcov=0.975; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003333 (amino acid transmembrane transport); GO:0005774 (vacuolar membrane); GO:0015171 (amino acid transmembrane transporter activity)
KEGG	-
Pfam	PF01490 (Aa_trans)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997806

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057779229.1`
2	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057779229.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.60000	`XP_057779229.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779229.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779229.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:57298796`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B123,C28,C39
`Chr1:57299036`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr1:57299072`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr1:57299147`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,C87
`Chr1:57299154`	`AGC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B91,C57
`Chr1:57299154`	`AGC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B91,C57
`Chr1:57299231`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,C3,C53
`Chr1:57299299`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C56
`Chr1:57299567`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,C87
`Chr1:57300288`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B27,C29,C63
`Chr1:57300298`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr1:57300345`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B38,C70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779229.1

440 aa

220

440

Aa_trans

PF01490 Aa_trans 45-424 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779229.1`	Pfam	`PF01490`	Aa_trans	Domain	45	424	4.9e-67	227.1	Transmembrane amino acid transporter protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923246.1
AACCCATATAAATACGCACACACATTACCTTCACCTTCAACCATATATACAAATATCAATTTCTTCCATTGTATTTCGCTCTATACTTGAACCAAACAATGACGGCCAGGATTTGGGAATCCCAAGAGGAAGCCGGTGAGAAAGCTGCGGCGGAGGAGCGGCCGAGCACCGTGGGCGACGAGGAAGAAGATGAGAAAAGTGCAGTTAAGACCCATGCAGATGATCGAACCACTGGCTCTTTTCTTCATGCAGTCATCAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997806
ATGACGGCCAGGATTTGGGAATCCCAAGAGGAAGCCGGTGAGAAAGCTGCGGCGGAGGAGCGGCCGAGCACCGTGGGCGACGAGGAAGAAGATGAGAAAAGTGCAGTTAAGACCCATGCAGATGATCGAACCACTGGCTCTTTTCTTCATGCAGTCATCAACATGGTTGGAATGCTCATTGGTTTGGGACAACTATCAACTCCCTATGCCTTGGAAAATGGAGGATGGGCATCAACATTCCTCCTAGTAGGGCTTGGAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779229.1
MTARIWESQEEAGEKAAAEERPSTVGDEEEDEKSAVKTHADDRTTGSFLHAVINMVGMLIGLGQLSTPYALENGGWASTFLLVGLGAVCAYSSCLLGKCMHKNPKSRDYKDIGNEAFGSKGRIIATTFIYLEIFMALVSYTISLHDNLANVFATFTLNSAHLSASQLLALIAVLVALPSLWLRDLSSISFLSTAGILLSLVIFSTVAYTAISGAVQAHRYIPVLHLNKIPAISGLYIFSFAGHIVFPNLYNSMKDPSKFT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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