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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003262`

染色体: Chr08 坐标: 33623713-33626393 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003262`
名称	SmilChr08G003262
描述	uncharacterized SmilChr08G003262
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	33623713 - 33626393 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997831`
GeneID	`130997831`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997831`
原始查询	`LOC130997831`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Major facilitator superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818506]; symbol=AT2G39210; hit=AT2G39210; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Major facilitator superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818506]; symbol=AT2G39210; hit=AT2G39210; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G39210` (AT2G39210) Major facilitator superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818506] identity=62; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0800000` (OSJNBa0052F07.13) - identity=57.7; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF06813 (Nodulin-like); PF23262 (NFD4_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997831

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057779246.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057779246.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057779246.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779246.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779246.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:33624947`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B61
`Chr8:33625083`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr8:33625231`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,C4,C67
`Chr8:33625424`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr8:33625555`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr8:33625741`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr8:33625751`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr8:33625870`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B30,B65,B88,C64,C66
`Chr8:33626192`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779246.1

555 aa

278

555

Nodulin-like

NFD4_C

PF06813 Nodulin-like 18-263 aa PF23262 NFD4_C 324-539 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779246.1`	Pfam	`PF06813`	Nodulin-like	Domain	18	263	7.7e-90	301.5	Nodulin-like
`XP_057779246.1`	Pfam	`PF23262`	NFD4_C	Domain	324	539	2.3e-14	54.4	NFD4, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923263.1
TCGATATTTATATATTCTTTGACTTCTCTTTGGCAATTAACAATGAGGGGACGAGAGCAGACGATTTGCGGCTGGCTTGTGGTGTCAAATACAGGAGACTTGGTTCTTGCTTATTTTTTTGAGAGTTTCAAGGTTTTGATTGGAGTAATTGGTAACAGTTTGTTTATTTATTTATAGTATTGATTATGTTTTCTTTCTATTTAATTATGATTTATTTCAATAATATGAGTTATTTTAATTCCTAGTATTATTTATAATGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997831
ATGGTGGCGGTGGGGCTCGGCGGCGGCCTAGGCACGGCGCTGCTTCGAAGCCGATGGTTCATGGTGTTCGGGTGCCTGCTGATCATGTCGATGTCGGGGGCCACCTACATCTTCGGCCTCTACTCCAACGACCTCAAGACCTCCCTGGGCTACGACCAGACGACGCTCAACCTCATCGGCTTCTTCAAGGACCTCGGCGGCAACATCGGCGTCATGTCCGGCGTCATCAACGAGTTCTCCCCGCCCTGGGTCGTCCTCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779246.1
MVAVGLGGGLGTALLRSRWFMVFGCLLIMSMSGATYIFGLYSNDLKTSLGYDQTTLNLIGFFKDLGGNIGVMSGVINEFSPPWVVLAIGMSMNFSGYFMIWLAVTGRISPPRVWQICLYICVGANSQTFSNTGALVTCVKNFPQSRGIVIGLLKGFTGLSGAIMSQLFHAFYGADSKSLILLIAWLPAAVSLVFLPAVRLMKPDNKPESEVRVFYHLLYISLGLAGFLMIAIIVENWLTDSQKLYAVSATVVLILLFAPL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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