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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID,以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因,再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr08G003263

染色体: Chr08 坐标: 33649137-33652104 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr08G003263
名称SmilChr08G003263
描述uncharacterized SmilChr08G003263
染色体 / SeqIDChr08 / NC_080394.1
坐标与链方向33649137 - 33652104 / +

ID 对照

NCBI Gene IDLOC130997832
GeneID130997832
locus_tag-
NCBI NameLOC130997832
原始查询LOC130997832

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818256]; symbol=AT2G36835; hit=AT2G36835; species=arabidopsis; confidence=high
产物uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818256]; symbol=AT2G36835; hit=AT2G36835; species=arabidopsis; confidence=high
ArabidopsisAT2G36835 (AT2G36835)
uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818256]
identity=64.2; qcov=0.968; evalue=1.34e-57; confidence=high
RiceOs01g0776700 (P0413G02.21)
-
identity=57.5; qcov=0.855; evalue=3.11e-44; confidence=medium
GOGO:0009941 (chloroplast envelope)
KEGG-
Pfam-
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:130997832

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Mitochondrion 线粒体 0.60000 XP_057779247.1
2 Cytoplasm 细胞质 0.40000 XP_057779247.1
3 Nucleus 细胞核 0.00000 XP_057779247.1
4 Chromosome 染色体 0.00000 XP_057779247.1
5 Centromere 着丝粒 0.00000 XP_057779247.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变,或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中,此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA(仅基因区域)

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA
XM_057923264.1
TAGTATTATTTATAGTTTACGAAACTGAGAATGTGAGATCATAGCTAAAATCGCTATCCTTCTCTAAAAGAAAAGAAAAAACTAAAGTCGGTAATCTCATTTCTTTAACAGTTAAATGCGACATCTGCTCGTTGCTTCTTCCTCGCCAAAAAAAAAAAAAAAGTCCTACCCATCGAGGCATCGACAGTCTCGTCTTCAATTAAAAATAATCCAAATTCTTATCTTCAACAGCACAAAAGAAAACACACTGGATATTCTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA
LOC130997832
ATGTCGGTAAAAGGAGCTGCCCTACAGAAAGATGTTCCATGGAGGGCGTCCTCGGCTGCAAAACCTATTCCTAAAATTCATCACGCTCCCATTCTTCGCCTCCCTCAGAATCCTTATTCTGAATTTGCCCTTTCTGTTATGAAGCATGACAATCCAATTGGGAGTGGACTAGGGAAAGAGGCTGTGGTTGAATCTGCAGGGCCAGACTGCATTGTGCCTGGGCAAACTGTACCGATCAAATTACTTGGTCTTAAGGTATG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA
XP_057779247.1
MSVKGAALQKDVPWRASSAAKPIPKIHHAPILRLPQNPYSEFALSVMKHDNPIGSGLGKEAVVESAGPDCIVPGQTVPIKLLGLKVWPIEVDLKFMEPVGRELRSIGKFMDSAVDLMNKSFIDR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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