当前解析结果
SmilChr08G003289| 统一新 Gene ID | SmilChr08G003289 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G003289 |
| 描述 | thaumatin-like protein 1b |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 34008028 - 34009245 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130997856 |
|---|---|
| GeneID | 130997856 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130997856 |
| 原始查询 | LOC130997856 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | thaumatin-like protein 1b |
| 产物 | thaumatin-like protein 1b |
| Arabidopsis | AT1G75800 (AT1G75800)Pathosis-related thaumatin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843913] identity=54.1; qcov=0.949; evalue=6.7e-86; confidence=high |
| Rice | Os07g0417600- identity=56.2; qcov=0.886; evalue=2.29e-82; confidence=high |
| GO | GO:0005576 (extracellular region); GO:0006952 (defense response) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00314 (Thaumatin) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130997856 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell wall | 细胞壁 | 0.60000 | XP_057779266.1 |
| 2 | Secreted | 分泌到胞外 | 0.60000 | XP_057779266.1 |
| 3 | Vacuole | 液泡 | 0.20000 | XP_057779266.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057779266.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057779266.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057779266.1PF00314
Thaumatin 46-255 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057779266.1 |
Pfam | PF00314 |
Thaumatin | Domain | 46 | 255 | 5.7e-84 | 281.7 | Thaumatin family |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。