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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003295`

染色体: Chr08 坐标: 34079995-34080725 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003295`
名称	SmilChr08G003295
描述	uncharacterized SmilChr08G003295
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	34079995 - 34080725 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997860`
GeneID	`130997860`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997860`
原始查询	`LOC130997860`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0166000; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os03g0166000; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G07030` (AT3G07030) Alba DNA/RNA-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768790] identity=69.2; qcov=0.7; evalue=5.06e-35; confidence=medium
Rice	`Os03g0166000` - identity=73.6; qcov=0.7; evalue=6.52e-39; confidence=medium
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF01918 (Alba); PF12328 (Rpp20)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997860

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057779270.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057779270.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057779270.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779270.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779270.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:34080001`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B22
`Chr8:34080001`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B22
`Chr8:34080011`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B30,B90,B92,C39
`Chr8:34080039`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	26	A16,B124,B125,B138,B14,B22,B50,B54,B55,B66,B67,B73,B8,B83,B90,B91,C18,C37,C5,C54,C57,C58,C60,C76,C81,D5
`Chr8:34080092`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81
`Chr8:34080171`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr8:34080387`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B41,B62,C31,C41,C75
`Chr8:34080387`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B41,B62,C31,C41,C75
`Chr8:34080630`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B41,B62,C31,C41,C75
`Chr8:34080630`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B41,B62,C31,C41,C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779270.1

130 aa

130

Alba

Rpp20

PF01918 Alba 45-89 aa PF12328 Rpp20 47-117 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779270.1`	Pfam	`PF01918`	Alba	Domain	45	89	7.3e-11	42.4	Alba
`XP_057779270.1`	Pfam	`PF12328`	Rpp20	Family	47	117	4.1e-09	37.1	Rpp20 subunit of nuclear RNase MRP and P

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923287.1
AATGGTGTTTGTATTGGGATTATATATCTTTAGGAGAAATTTCTCATGCATGACTTCATCGGTTTATTTTATGGATTGTTTGTTTTCCTCTATACTGCTGAAATTGCCTGCTAATGATTATTCTGTTAATTTCCTTTTTTCTCAGGAGAGACAAGTGAAAGAGATTGTCTTAAAGGCAATGGGCCAGGCTATAAACAAAACTGTGGCTATTGCAGAAATCATTAAGAGAAGAGTTCCTCGACTGCATCAGGACACTGCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997860
ATGGTGTTTGTATTGGGATTATATATCTTTAGGAGAAATTTCTCATGCATGACTTCATCGGTTTATTTTATGGATTGTTTGTTTTCCTCTATACTGCTGAAATTGCCTGCTAATGATTATTCTGTTAATTTCCTTTTTTCTCAGGAGAGACAAGTGAAAGAGATTGTCTTAAAGGCAATGGGCCAGGCTATAAACAAAACTGTGGCTATTGCAGAAATCATTAAGAGAAGAGTTCCTCGACTGCATCAGGACACTGCCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779270.1
MVFVLGLYIFRRNFSCMTSSVYFMDCLFSSILLKLPANDYSVNFLFSQERQVKEIVLKAMGQAINKTVAIAEIIKRRVPRLHQDTAISSVSITDTFEPIEEGLQIVEQTRHVSMISITLSTKELNQNSPG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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