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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003309`

染色体: Chr08 坐标: 34282811-34285116 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003309`
名称	SmilChr08G003309
描述	purine-uracil permease NCS1
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	34282811 - 34285116 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997870`
GeneID	`130997870`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997870`
原始查询	`LOC130997870`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	purine-uracil permease NCS1
产物	purine-uracil permease NCS1
Arabidopsis	`AT5G03555` (NCS1) permease, cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831791] identity=72.1; qcov=0.858; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0666700` - identity=59.1; qcov=0.924; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0015205 (nucleobase transmembrane transporter activity); GO:0015851 (nucleobase transport); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF02133 (Transp_cyt_pur)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997870

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057779283.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057779283.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779283.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779283.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779283.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:34283100`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,C39
`Chr8:34283573`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr8:34283898`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B56,B96,D4
`Chr8:34283972`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,C30
`Chr8:34283997`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr8:34284065`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr8:34284156`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B57,B99
`Chr8:34284282`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr8:34284422`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B8
`Chr8:34284422`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B8
`Chr8:34284455`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B68,B74,D7
`Chr8:34284500`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779283.1

555 aa

278

555

Transp_cyt_pur

PF02133 Transp_cyt_pur 87-524 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779283.1`	Pfam	`PF02133`	Transp_cyt_pur	Family	87	524	3.2e-96	323.5	Permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923300.1
GTCAACGTTTGTGATTTTTTTTTTTGAATAAATTAACAGTATTAAATAAAGAAATTTAAAGACCGCCCTACAGGAGACTCGAATCCGAAATCTTTGGCCTCAGGCATTAACCCCTTACTGCTTGACCAACACACGCACACCGTTTGTGATTCATTTTGATATTATGTAAGGTCGCATGTGGAATCAAGCATTCGTATTAGGAATCAGATCTGCGCCAGACTTTTGTGCTGGTAGTTCCAGGACACTCGCCTCTAATCCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997870
ATGGTGTCCAAATGTTTGAGCTTCAGTCTCCATCTCCACCAAAACCACATCTTCTCAAACCCAAAACCCAACTACCACTTGAAGAAATCACTAATATTCCCAACCAACTTAACTAAAAAACACCCAACCCTGCCGAAAAGATGCTACCCATATCCCCTGATGTCATCAAATCATTCTCAAACAATCTCCCAGTTCAACGAGTGGGAGCCCGACCCGACCCTGACGAACGATGACCTCAAGCCGACGGCGTGGGCCCACCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779283.1
MVSKCLSFSLHLHQNHIFSNPKPNYHLKKSLIFPTNLTKKHPTLPKRCYPYPLMSSNHSQTISQFNEWEPDPTLTNDDLKPTAWAHRSLSGVDMASLWVGLVVGVPSYYLAGSLVDLGMAWWQGIATVVAANIILLFPLVLTGHPGTKYGISFPVLARSSFGIRGAHIPTLLRALVGCGWYGIESWIGGEAILLLLPRVLKESSLAEPLKWLGTSPLAFGCFIVFWLLQLGTFWNGIEGIRQLEKYAAPILTLLTLSLLM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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