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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003908`

染色体: Chr01 坐标: 57360400-57372495 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003908`
名称	SmilChr01G003908
描述	histone-lysine N-methyltransferase ATX2-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	57360400 - 57372495 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997873`
GeneID	`130997873`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997873`
原始查询	`LOC130997873`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	histone-lysine N-methyltransferase ATX2-like
产物	histone-lysine N-methyltransferase ATX2-like
Arabidopsis	`AT1G05830` (ATX2) trithorax-like protein 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837093] identity=59.3; qcov=0.974; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0134500` (OsTrx1) - identity=56.4; qcov=0.971; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000785 (chromatin); GO:0005515 (protein binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II)
KEGG	-
Pfam	PF00856 (SET); PF05964 (FYRN); PF05965 (FYRC); PF13771 (zf-HC5HC2H); PF13831 (PHD_2); PF13832 (zf-HC5HC2H_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997873

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779288.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779288.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779288.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779288.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057779288.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:57361194`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr1:57362027`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B86
`Chr1:57362036`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr1:57362383`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779288.1

727 aa

364

727

FYRN

FYRC

PHD_2

zf-HC5HC2H_2

zf-HC5HC2H

SET

PF05964 FYRN 96-153 aa PF05965 FYRC 160-232 aa PF13831 PHD_2 274-307 aa PF13832 zf-HC5HC2H_2 317-438 aa PF13771 zf-HC5HC2H 337-439 aa PF00856 SET 574-680 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779288.1`	Pfam	`PF05964`	FYRN	Family	96	153	2.5e-19	69.4	F/Y-rich N-terminus
`XP_057779288.1`	Pfam	`PF05965`	FYRC	Family	160	232	7.1e-13	49.2	F/Y rich C-terminus
`XP_057779288.1`	Pfam	`PF13831`	PHD_2	Family	274	307	8.1e-07	29.1	PHD-finger
`XP_057779288.1`	Pfam	`PF13832`	zf-HC5HC2H_2	Domain	317	438	1.9e-31	109.2	PHD-zinc-finger like domain
`XP_057779288.1`	Pfam	`PF13771`	zf-HC5HC2H	Domain	337	439	2.3e-20	73.3	PHD-like zinc-binding domain
`XP_057779288.1`	Pfam	`PF00856`	SET	Family	574	680	6.8e-25	88.3	SET domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923305.1
CAAAGTATGGAGTTGAAGTTATGTAAGAAGAGCTCCGAAGCTGATGAACTTGATACTAACGAGATGGTGGTTTTGGCCGCTAGTTTAGATGATGATTGCCAAGAGATTGAGACTGGAGATCTAATTTGGGCTAAACTTACTGGACATGCTGTATGGCCGGCAATTGTTTTAGATGAATCTCATGTGGGTAAACACAAGGGATTAAGCAAAATTTCCGGAGAAAAGTCTGTCGTTGTTCAATTCTTTGGCACCTATGATTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997873
ATGATTTTGCTAGGGTTGCCCGGAAACAAGTTATCTCTTTCCTCAAGGGCCTTCTTTCGTCCTGTCATTCAAAGTGCAAGAAACCCGACTTTTGTTCGAGGATTGGAGGAGGCAAAAGTATATCTTAGTGAACAGAGGCTACCAGAGAGAATGCAGCAGCTGCGAGATGGTGTTGACAGTGATGCAAATGATAATAGAAGTGGGGAGAATGAAGATGGTGCTGACTCAGATGGTGAGTCCATGAGTCATGATGAGATACT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779288.1
MILLGLPGNKLSLSSRAFFRPVIQSARNPTFVRGLEEAKVYLSEQRLPERMQQLRDGVDSDANDNRSGENEDGADSDGESMSHDEILKKLDDLKSCPLEDGELQIVSLGKIVRDSSNFQNEKFIWPEGYTAVRMFTSLTDPTVHTMYKMEVLRDVDSRTRPLFKVTGDNGEEFNGPTPSACWNKIYKKIRIVQIRNKDYKADQNFSSGSCMFGFSHPKVSRLIKEMSNSRSAAKSYQLSKKMKNSSTGYRPVTVTWMDLD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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