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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003312`

染色体: Chr08 坐标: 34301753-34304183 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003312`
名称	SmilChr08G003312
描述	protein RGF1 INDUCIBLE TRANSCRIPTION FACTOR 1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	34301753 - 34304183 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997874`
GeneID	`130997874`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997874`
原始查询	`LOC130997874`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein RGF1 INDUCIBLE TRANSCRIPTION FACTOR 1-like
产物	protein RGF1 INDUCIBLE TRANSCRIPTION FACTOR 1-like
Arabidopsis	`AT2G27930` (AT2G27930) PLATZ transcription factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817337] identity=52.8; qcov=1.03; evalue=2.71e-68; confidence=high
Rice	`Os04g0591100` - identity=53.3; qcov=1.02; evalue=3.12e-72; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04640 (PLATZ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997874

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057779286.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057779286.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779286.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779286.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779286.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:34302670`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr8:34303134`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr8:34303143`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr8:34303146`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16
`Chr8:34303155`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,C59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779286.1

221 aa

110

221

PLATZ

PF04640 PLATZ 76-147 aa

XP_057779287.1

208 aa

104

208

PLATZ

PF04640 PLATZ 63-134 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779286.1`	Pfam	`PF04640`	PLATZ	Family	76	147	1.4e-30	106.4	PLATZ transcription factor
`XP_057779287.1`	Pfam	`PF04640`	PLATZ	Family	63	134	1.2e-30	106.6	PLATZ transcription factor

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923303.1
AAAAATGGGAAATCTGGAGGGTATTTTGGAGAAATCACAATATAGCTTTTAATTTAGAGTAGAGAACTCAAGCAAACGCAACGACGTCGTAGTTGGAAGCCCTTTTGTAGCGTAGCTCGGTGGCCGACCCTCATGTCTACGTGCAGACGCAAAGAAGATCCAAAAAATTGTAGCGGCACAATGCTGGTTCCTCCGTGGCTGGAGCGGCTCCTCAACACCTCATTCTTCAACATCTGCCGCACCCACGGCGACGCCGCCCG...

XM_057923304.1
CGTAGTTGGAAGCCCTTTTGTAGCGTAGCTCGGTGGCCGACCCTCATGTCTACGTGCAGACGCAAAGAAGATCCAAAAAATTGTAGCGTAAGCGCCAAACCCTTCCTTCTCTCTCCTCACATCCAACGGCGCACTAAAATCCTCAGCCACCCCTTCCGATCTCCACCGTTGCTTGCTTTATTTTCTTCATAATTTTAGGCTTTTGTCCCTTCCTTAGCTTAGGTGTAGTTTTGTTGTTGATTTTTAAGTTGCTGGTTGTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130997874
ATGTCTACGTGCAGACGCAAAGAAGATCCAAAAAATTGTAGCGGCACAATGCTGGTTCCTCCGTGGCTGGAGCGGCTCCTCAACACCTCATTCTTCAACATCTGCCGCACCCACGGCGACGCCGCCCGCAGCGAATGCAACATGTATTGCTTGGACTGCAATGCCGACGCCTTCTGCTTCTACTGCCGCTCCTCCAAACACAAAGACCATCAAGTAATTCAGATACGGCGATCTTCGTACCATGATGTGGTGAGGGTTTC...

LOC130997874
ATGGGCACAATGCTGGTTCCTCCGTGGCTGGAGCGGCTCCTCAACACCTCATTCTTCAACATCTGCCGCACCCACGGCGACGCCGCCCGCAGCGAATGCAACATGTATTGCTTGGACTGCAATGCCGACGCCTTCTGCTTCTACTGCCGCTCCTCCAAACACAAAGACCATCAAGTAATTCAGATACGGCGATCTTCGTACCATGATGTGGTGAGGGTTTCGGAGATTCAGAAGGTTTTGGACATAAGCGGAGTTCAGAC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057779286.1
MSTCRRKEDPKNCSGTMLVPPWLERLLNTSFFNICRTHGDAARSECNMYCLDCNADAFCFYCRSSKHKDHQVIQIRRSSYHDVVRVSEIQKVLDISGVQTYVINSARVLFLNERPQPKGGKAVSHVCEICGRSLLDTFRFCSLGCKVVGIKGNGDASFIEAASSSRRGGGNYMMSSSSSRDQEEELRDGSQQDIYPPTPPPPPSSSRSRRKGIPQRAPFRS

XP_057779287.1
MGTMLVPPWLERLLNTSFFNICRTHGDAARSECNMYCLDCNADAFCFYCRSSKHKDHQVIQIRRSSYHDVVRVSEIQKVLDISGVQTYVINSARVLFLNERPQPKGGKAVSHVCEICGRSLLDTFRFCSLGCKVVGIKGNGDASFIEAASSSRRGGGNYMMSSSSSRDQEEELRDGSQQDIYPPTPPPPPSSSRSRRKGIPQRAPFRS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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