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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003323`

染色体: Chr08 坐标: 34500005-34505128 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003323`
名称	SmilChr08G003323
描述	aspartic proteinase 36-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	34500005 - 34505128 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997884`
GeneID	`130997884`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997884`
原始查询	`LOC130997884`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aspartic proteinase 36-like
产物	aspartic proteinase 36-like
Arabidopsis	`AT2G36670` (AT2G36670) Eukaryotic aspartyl protease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818239] identity=63.6; qcov=0.959; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0777200` (P0413G02.28) - identity=57; qcov=0.906; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004190 (aspartic-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00026 (Asp); PF14541 (TAXi_C); PF14543 (TAXi_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997884

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057779298.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057779298.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057779298.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779298.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779298.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:34500330`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr8:34501001`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B17,C13,C24
`Chr8:34501325`	`G`	`GTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	93	A10,A11,A14,A16,A18,A20,A22,A23,A25,A6,B1,B10,B104,B106,B109,B110,B115,B119,B120,B122,B124,B126,B131,B132,B133,B135,B136,B137,B140,B20,B27,B3,B34,B37,B38,B39,B4,B43,B44,B45,B46,B48,B50,B51,B57,B6,B60,B63,B66,B67,B7,B8,B81,B84,B88,B91,B93,B97,B99,C1,C10,C11,C14,C15,C2,C23,C24,C25,C26,C28,C3,C32,C39,C41,C46,C52,C59,C64,C66,C69,C7,C70,C73,C75,C8,C81,C82,C86,C9,D10,D11,D2,D6
`Chr8:34501382`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	A25,B113,B50,C18
`Chr8:34501382`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	CDS_variant	4	A25,B113,B50,C18
`Chr8:34502807`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B134,B74,D7
`Chr8:34504049`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr8:34504057`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B74,C73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779298.1

494 aa

247

494

TAXi_N

Asp

TAXi_C

PF14543 TAXi_N 86-271 aa PF00026 Asp 86-442 aa PF14541 TAXi_C 289-441 aa

XP_057779299.1

490 aa

245

490

TAXi_N

Asp

TAXi_C

PF14543 TAXi_N 82-267 aa PF00026 Asp 82-438 aa PF14541 TAXi_C 285-437 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779298.1`	Pfam	`PF14543`	TAXi_N	Domain	86	271	2.6e-41	142.4	Xylanase inhibitor N-terminal
`XP_057779298.1`	Pfam	`PF00026`	Asp	Domain	86	442	3.6e-30	106.2	Eukaryotic aspartyl protease
`XP_057779298.1`	Pfam	`PF14541`	TAXi_C	Domain	289	441	6.7e-23	82.0	Xylanase inhibitor C-terminal
`XP_057779299.1`	Pfam	`PF14543`	TAXi_N	Domain	82	267	2.5e-41	142.5	Xylanase inhibitor N-terminal
`XP_057779299.1`	Pfam	`PF00026`	Asp	Domain	82	438	3.5e-30	106.3	Eukaryotic aspartyl protease
`XP_057779299.1`	Pfam	`PF14541`	TAXi_C	Domain	285	437	6.6e-23	82.0	Xylanase inhibitor C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923315.1
AAAACAAATCTGCAAAACATACTTTTTTTTTAGTATAATGAAAGAGAAAGAGAGAATGCGTGCGTGTAGTGTGTGAATGGTGTATTTGTTTATGTACCTCGGACACCATTACTCCATTCTCAGCACTCACCTTTTCACTTTTCCCATTCTTATTTATTTTTTCGTTTACCATACATTTGCTAGAAAATTCGTACAACTTCTATACTCTATATTATACTATAGTGCGGCTTTTTGAGCGCCGGCGATGACTGTCCGGCTAA...

XM_057923316.1
AATGAAAGAGAAAGAGAGAATGCGTGCGTGTAGTGTGTGAATGGTGTATTTGTTTATGTACCTCGGACACCATTACTCCATTCTCAGCACTCACCTTTTCACTTTTCCCATTCTTATTTATTTTTTCGTTTACCATACATTTGCTAGAAAATTCGTACAACTTCTATACTCTATATTATACTATAGTGCGGCTTTTTGAGCGCCGGCGATGACTGTCCGGCTAATGACTGCGGTGGCGGTCGCAGTCGCTATTGCGGCCG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130997884
ATGACTGTCCGGCTAATGACTGCGGTGGCGGTCGCAGTCGCTATTGCGGCCGCCACTTTCCTGTCGACGGTGCGTGGCGCCGGAATTCAAGGAGTGCTTACTCTGCAGAGAGCGTTTCCAATTGATGAGAAGGTGGAGCTCGAGATTATTAAAGCTCGGGACCGTGCTCGCCACGCGCGTATTTTGCAGAGCTTTTCCGGCGGGATTGTTGATTTTCAGGTCGTCGGGACCTTCGACCCGTACGTCGTTGGACTTTATTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057779298.1
MTVRLMTAVAVAVAIAAATFLSTVRGAGIQGVLTLQRAFPIDEKVELEIIKARDRARHARILQSFSGGIVDFQVVGTFDPYVVGLYFTKVRLGTPPRDFNVQIDTGSDILWVACSSCTDCPQSSGLGIPLNFFDPAASSTVSSMSCSDNICASIVQSAAAECFGESNQCGYSFQYADQSGTAGFYVSDLLYFDSILGTSLVANSSAPIVFGCSTSLFGDLAKSTKALDGIFGFGRQDISVISQLSSYKIAPKVFSHCLKG...

XP_057779299.1
MTVRLMTAVAVAVAIAAATFLSTVRGAGIQGVLTLQRAFPIDEKVELEIIKARDRARHARILQSFSGGIVDFQVVGTFDPLYFTKVRLGTPPRDFNVQIDTGSDILWVACSSCTDCPQSSGLGIPLNFFDPAASSTVSSMSCSDNICASIVQSAAAECFGESNQCGYSFQYADQSGTAGFYVSDLLYFDSILGTSLVANSSAPIVFGCSTSLFGDLAKSTKALDGIFGFGRQDISVISQLSSYKIAPKVFSHCLKGDGNG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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