当前解析结果
SmilChr08G003325| 统一新 Gene ID | SmilChr08G003325 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G003325 |
| 描述 | peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP16-4, chloroplastic-like |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 34521102 - 34523806 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130997885 |
|---|---|
| GeneID | 130997885 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130997885 |
| 原始查询 | LOC130997885 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP16-4, chloroplastic-like |
| 产物 | peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP16-4%2C chloroplastic-like |
| Arabidopsis | AT3G10060 (AT3G10060)FKBP-like peptidyl-prolyl cis-trans isomerase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820167] identity=72.1; qcov=0.937; evalue=8.24e-102; confidence=high |
| Rice | Os02g0117600 (OsFKBP18)- identity=40.6; qcov=0.766; evalue=1.3e-25; confidence=medium |
| GO | GO:0003755 (peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00254 (FKBP_C) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130997885 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 1.00000 | XP_057779301.1 |
| 2 | Chloroplast thylakoid | 类囊体 | 1.00000 | XP_057779301.1 |
| 3 | Chloroplast stroma | 叶绿体基质 | 0.20000 | XP_057779301.1 |
| 4 | Chloroplast thylakoid membrane | 类囊体膜 | 0.20000 | XP_057779301.1 |
| 5 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057779301.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057779301.1PF00254
FKBP_C 111-206 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057779301.1 |
Pfam | PF00254 |
FKBP_C | Domain | 111 | 206 | 4e-22 | 79.1 | FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。