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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；公开文献名称仅收录身份已有序列证据的记录。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003359`

染色体: Chr08 坐标: 35017240-35019814 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一基因 ID	`SmilChr08G003359`
名称	SmilChr08G003359
描述	protein PSK SIMULATOR 1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	35017240 - 35019814 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997912`
GeneID	`130997912`
locus_tag	`-`
NCBI 名称	`LOC130997912`
原始查询	`LOC130997912`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein PSK SIMULATOR 1-like
产物	protein PSK SIMULATOR 1-like
拟南芥	`AT5G04550` (AT5G04550) type-1 restriction enzyme mjaxp r protein (DUF668) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830334] identity=37.67; qcov=0.926; evalue=3.14e-109; confidence=medium
水稻	`Os12g0146500` - identity=42.86; qcov=0.406; evalue=5.78e-45; confidence=low
GO	GO:0045927 (positive regulation of growth)
KEGG	-
Pfam	PF05003 (DUF668); PF11961 (DUF3475)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997912

打开注释模块

亚细胞定位候选（最多五项）

预测得分表示模型支持程度，不能作为定位概率；所有候选均需实验验证。

方法与数据说明

当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定；当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选，预测得分表示模型支持程度，不是校准概率，也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签，应谨慎解读其在植物中的适用性。四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核，原始投票全部一致。

排序	定位位置	预测得分	蛋白 ID
1	细胞质	0.80000	`SmilChr08G003359.1`
2	细胞核	0.60000	`SmilChr08G003359.1`
3	细胞质基质	0.20000	`SmilChr08G003359.3`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	参考等位基因	变异等位基因	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:35018009`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B74,C40,C73
`Chr8:35018379`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,C51,C63,C67,C87
`Chr8:35018978`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

SmilChr08G003359.1

来源蛋白: XP_057779324.1

557 aa

278

557

DUF3475

DUF668

PF11961 DUF3475 25-81 aa PF05003 DUF668 386-477 aa

SmilChr08G003359.2

来源蛋白: XP_057779325.1

557 aa

278

557

DUF3475

DUF668

PF11961 DUF3475 25-81 aa PF05003 DUF668 386-477 aa

SmilChr08G003359.3

来源蛋白: XP_057779326.1

525 aa

262

525

DUF3475

DUF668

PF11961 DUF3475 1-49 aa PF05003 DUF668 354-445 aa

蛋白 ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	得分	说明
`SmilChr08G003359.1` XP_057779324.1	Pfam	`PF11961`	DUF3475	Family	25	81	7.5e-23	81.1	Domain of unknown function (DUF3475)
`SmilChr08G003359.1` XP_057779324.1	Pfam	`PF05003`	DUF668	Family	386	477	2.2e-29	102.4	Protein of unknown function (DUF668)
`SmilChr08G003359.2` XP_057779325.1	Pfam	`PF11961`	DUF3475	Family	25	81	7.5e-23	81.1	Domain of unknown function (DUF3475)
`SmilChr08G003359.2` XP_057779325.1	Pfam	`PF05003`	DUF668	Family	386	477	2.2e-29	102.4	Protein of unknown function (DUF668)
`SmilChr08G003359.3` XP_057779326.1	Pfam	`PF11961`	DUF3475	Family	1	49	2.3e-17	63.5	Domain of unknown function (DUF3475)
`SmilChr08G003359.3` XP_057779326.1	Pfam	`PF05003`	DUF668	Family	354	445	1.9e-29	102.6	Protein of unknown function (DUF668)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。蛋白及对应 CDS 使用“基因 ID.序号”；序号在当前参考发布内固定，来源 accession 同时保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923342.1
CGACCCCAAAAGCACAGTCTTGGTCTGACCTCGTTGACATCGCGCACTCTAGTTTTGTACCCGCCTTGTAGTGGAATTTGTCAATTATCGCACCTATTTGACGCCGGCGGTGCACCACTTCATGAGATCGTCGTGCGGAAGTTGCTGCGGTTGATGTAAATTCGGCTGTAGTTGGGGAAATTCTCTGGAGTATTTGCTCTTATTTATTAGCTGAGAAGATGTTAGTTCAGAGAGTTTTGAGGAGTTCAAGTAGGCGCATC...

XM_057923341.1
TGACATCGCGCACTCTAGTTTTGTACCCGCCTTGTAGTGGAATTTGTCAATTATCGCACCTATTTGACGCCGGCGGTGCACCACTTCGTAATTTAGCTAACCTACACCCCCCCCCCTCCTCTGCTGCTTTACTTCGTTACGCACTATATCTATCTATATAGTTGCAGAATTTTCTCAATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCATTTGTCTGGATGGAAATGTAAAATCTTGCTTTTCATTTAGATGAGATCGTCGTGCG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

SmilChr08G003359.1 (XP_057779324.1)
ATGTTAGTTCAGAGAGTTTTGAGGAGTTCAAGTAGGCGCATCTATGGGGAACCTGAAAAACGACTAGTTCGAATTTTGGCATTTGAAATCTCGAGGATGATGTCGAAGGTTGTTAAGATCTGGCAGTCTGTCACTGTTAGACAAATTTCTAGACTGAAAGAAGAGATTGCCAACTCAGTTGGCATCCACAAGCTTGTTTCAGAAGACGACGACTACCTCATGGATCTTGCTCTTGCAGAGATTATTAATAATTTGATGGA...

SmilChr08G003359.2 (XP_057779325.1)
ATGTTAGTTCAGAGAGTTTTGAGGAGTTCAAGTAGGCGCATCTATGGGGAACCTGAAAAACGACTAGTTCGAATTTTGGCATTTGAAATCTCGAGGATGATGTCGAAGGTTGTTAAGATCTGGCAGTCTGTCACTGTTAGACAAATTTCTAGACTGAAAGAAGAGATTGCCAACTCAGTTGGCATCCACAAGCTTGTTTCAGAAGACGACGACTACCTCATGGATCTTGCTCTTGCAGAGATTATTAATAATTTGATGGA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

SmilChr08G003359.1 (XP_057779324.1)
MLVQRVLRSSSRRIYGEPEKRLVRILAFEISRMMSKVVKIWQSVTVRQISRLKEEIANSVGIHKLVSEDDDYLMDLALAEIINNLMDLGKSVAMLGKKCEDSTYHNLETVFDDPSAIDPKWHGWQYRLKKMDRKVKKMEKFVAATEKLHSELEELAELEQSLKRMQAGANLGKMKLIELRHQVLWQRQEVKSLQELSPWVRTYDYVVRLLLRSLFTIIERIKYAFGSDQIGDDADGSDWLRSRCNSMSGLEQTSEYSSEN...

SmilChr08G003359.2 (XP_057779325.1)
MLVQRVLRSSSRRIYGEPEKRLVRILAFEISRMMSKVVKIWQSVTVRQISRLKEEIANSVGIHKLVSEDDDYLMDLALAEIINNLMDLGKSVAMLGKKCEDSTYHNLETVFDDPSAIDPKWHGWQYRLKKMDRKVKKMEKFVAATEKLHSELEELAELEQSLKRMQAGANLGKMKLIELRHQVLWQRQEVKSLQELSPWVRTYDYVVRLLLRSLFTIIERIKYAFGSDQIGDDADGSDWLRSRCNSMSGLEQTSEYSSEN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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