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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003368`

染色体: Chr08 坐标: 35297864-35298937 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003368`
名称	SmilChr08G003368
描述	peroxiredoxin-2E-1, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	35297864 - 35298937 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997924`
GeneID	`130997924`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997924`
原始查询	`LOC130997924`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peroxiredoxin-2E-1, chloroplastic-like
产物	peroxiredoxin-2E-1%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT3G52960` (AT3G52960) Thioredoxin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824462] identity=68.57; qcov=0.763; evalue=1.42e-87; confidence=high
Rice	`Os06g0625500` (OsPrxII) - identity=76.88; qcov=0.697; evalue=5.86e-90; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0008379 (thioredoxin peroxidase activity); GO:0034599 (cellular response to oxidative stress); GO:0042744 (hydrogen peroxide catabolic process); GO:0045454 (cell redox homeostasis)
KEGG	-
Pfam	PF00578 (AhpC-TSA); PF08534 (Redoxin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997924

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

特征证据限制：抽查两个保留的历史缓存共 206 行，PROFEAT 特征全部为零；第二块缓存为 106 行，比对应 FASTA 的 100 个蛋白多 6 个。ESM2 特征在抽查范围内为有限非零值。缓存与当前定位结果的历史执行链仍未核实，不能据蛋白编号重合认定这些特征用于线上预测，也不能将抽查推广到全蛋白组。当前结果仅作为探索性候选，特征完整性与预测可靠性尚未建立。

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057779335.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057779335.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:35298132`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B47,B49,B50,C56
`Chr8:35298333`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C2,C32
`Chr8:35298350`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779335.1

228 aa

114

228

AhpC-TSA

Redoxin

PF00578 AhpC-TSA 69-204 aa PF08534 Redoxin 69-224 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779335.1`	Pfam	`PF00578`	AhpC-TSA	Domain	69	204	1.3e-16	61.4	AhpC/TSA family
`XP_057779335.1`	Pfam	`PF08534`	Redoxin	Domain	69	224	4.1e-37	127.9	Redoxin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923352.1
GGAAATTATTTAAATATTAAGTATAGAGAGAGTGTATTGCCAAAAAAGGAAACAGGACATTTCAAGTGGGACAACCCAAAAATGAAAACAGGACATTTCAGCTGGGACGGAGGGAGTACATAGTTTAGATAGCAAGATATTTTTACCCAAAATATATAAATACTCCAAAACCTAATTAAAGTCCAACAGCTACAAGCCTACAATCTGGAGAAGAGGCCAGAACGTTCTCCGCAAACTTCACTTGCGAATTACAGGGGGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080394.1_cds_XP_057779335.1_44598
ATGGCAGCCGCCGCCGCAACATCAGCCGCCTTCGTCACCGCGAGGCTCCTCGCTTCCTCCTCTCGGAAACTCAAACAACCCTTCTCTCTCCTCTCTCCACAAAAAAGATCCAGCTCCTTTTCCATCAATTCTGCCCCACTCCCCCTCCGCCGCCCCCAAACCCTCCGATTCTCCACCGTCCCCAGCATATCCGCCACGATCTCCGTCGGCGACAAGCTGCCTGACGCCACCCTCTCCTACTTCGACTCCGCCGACGAGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779335.1
MAAAAATSAAFVTARLLASSSRKLKQPFSLLSPQKRSSSFSINSAPLPLRRPQTLRFSTVPSISATISVGDKLPDATLSYFDSADELQTVSVADLTSGKKVILFAVPGAFTPTCSQKHLPGFAAKAADLKAKGVDTIACVSVNDAFVMKAWKEDLKIGDDVLMLSDGNGDFTRAIGCELDLSDKPVGLGVRSRRYAMFVENGVVKILNLEEGGAFNVSSAEDILKAIS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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