当前解析结果
SmilChr08G003377| 统一新 Gene ID | SmilChr08G003377 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G003377 |
| 描述 | 1,4-alpha-glucan-branching enzyme 1, chloroplastic/amyloplastic-like |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 35389404 - 35391711 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130997930 |
|---|---|
| GeneID | 130997930 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130997930 |
| 原始查询 | LOC130997930 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | 1,4-alpha-glucan-branching enzyme 1, chloroplastic/amyloplastic-like |
| 产物 | 1%2C4-alpha-glucan-branching enzyme 1%2C chloroplastic/amyloplastic-like |
| Arabidopsis | AT5G03650 (SBE2.2)starch branching enzyme 2.2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831769] identity=77.7; qcov=0.85; evalue=1.37e-69; confidence=high |
| Rice | Os02g0528200 (SBE3)- identity=74; qcov=0.83; evalue=9.55e-62; confidence=high |
| GO | GO:0003844 (1,4-alpha-glucan branching enzyme activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005982 (starch metabolic process); GO:0043169 (cation binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF02806 (Alpha-amylase_C) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130997930 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057779347.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057779347.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057779347.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057779347.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057779347.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057779347.1PF02806
Alpha-amylase_C 38-132 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057779347.1 |
Pfam | PF02806 |
Alpha-amylase_C | Domain | 38 | 132 | 8.9e-23 | 81.2 | Alpha amylase, C-terminal all-beta domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。