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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003384`

染色体: Chr08 坐标: 35585426-35586246 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003384`
名称	SmilChr08G003384
描述	peroxiredoxin-2E-1, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	35585426 - 35586246 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997933`
GeneID	`130997933`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997933`
原始查询	`LOC130997933`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peroxiredoxin-2E-1, chloroplastic-like
产物	peroxiredoxin-2E-1%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT3G52960` (AT3G52960) Thioredoxin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824462] identity=68.6; qcov=0.768; evalue=1.58e-87; confidence=high
Rice	`Os06g0625500` (OsPrxII) - identity=76.9; qcov=0.702; evalue=5.55e-90; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0008379 (thioredoxin peroxidase activity); GO:0034599 (cellular response to oxidative stress); GO:0042744 (hydrogen peroxide catabolic process); GO:0045454 (cell redox homeostasis)
KEGG	-
Pfam	PF00578 (AhpC-TSA); PF08534 (Redoxin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997933

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057779350.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057779350.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779350.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779350.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779350.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:35585439`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B56,B96,D4
`Chr8:35585560`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr8:35585653`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B62,C14
`Chr8:35585833`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B60,B94
`Chr8:35585932`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779350.1

228 aa

114

228

AhpC-TSA

Redoxin

PF00578 AhpC-TSA 69-204 aa PF08534 Redoxin 69-224 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779350.1`	Pfam	`PF00578`	AhpC-TSA	Domain	69	204	1.3e-16	61.4	AhpC/TSA family
`XP_057779350.1`	Pfam	`PF08534`	Redoxin	Domain	69	224	4.1e-37	127.9	Redoxin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923367.1
ATGGCAGCCACCGCCGCAACATCAGCCGCCTTCGTCACCGCGAGGCTCCTCGCTTCCTCCTCTCGGAAACTCAAACAACCCTTCTCTCTCCTCTCTCCACAAAAAAGATCCAGCTCCTTTTCCATCAATTCTGCCCCACTCCCCCTCCGCCGCCCCCAAACCCTCCGATTCTCCACCGTCCCCAGCATATCCGCCACGATCTCCGTCGGCGACAAGCTGCCTGACGCCACCCTCTCCTACTTCGACTCCGCCGACGAGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997933
ATGGCAGCCACCGCCGCAACATCAGCCGCCTTCGTCACCGCGAGGCTCCTCGCTTCCTCCTCTCGGAAACTCAAACAACCCTTCTCTCTCCTCTCTCCACAAAAAAGATCCAGCTCCTTTTCCATCAATTCTGCCCCACTCCCCCTCCGCCGCCCCCAAACCCTCCGATTCTCCACCGTCCCCAGCATATCCGCCACGATCTCCGTCGGCGACAAGCTGCCTGACGCCACCCTCTCCTACTTCGACTCCGCCGACGAGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779350.1
MAATAATSAAFVTARLLASSSRKLKQPFSLLSPQKRSSSFSINSAPLPLRRPQTLRFSTVPSISATISVGDKLPDATLSYFDSADELQTVSVADLTSGKKVILFAVPGAFTPTCSQKHLPGFAAKAADLKAKGVDTIACVSVNDAFVMKAWKEDLKIGDDVLMLSDGNGDFTRAIGCELDLSDKPVGLGVRSRRYAMFVENGVVKILNLEEGGAFNVSSAEDILKAIS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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