当前解析结果
SmilChr08G003385| 统一新 Gene ID | SmilChr08G003385 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G003385 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G003385 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 35590311 - 35590935 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130997934 |
|---|---|
| GeneID | 130997934 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130997934 |
| 原始查询 | LOC130997934 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130997934 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057779351.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057779351.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057779351.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057779351.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057779351.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:35590460 |
GC |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 154 | A1,A14,A2,A20,A23,A24,A25,A3,A5,A6,A7,B1,B100,B101,B102,B104,B105,B109,B111,B112,B113,B114,B115,B12,B121,B124,B126,B128,B130,B132,B133,B134,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B140,B15,B18,B19,B20,B22,B24,B26,B28,B29,B30,B36,B39,B4,B40,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B49,B51,B52,B54,B55,B56,B57,B58,B61,B62,B63,B64,B67,B68,B69,B7,B71,B75,B76,B78,B79,B80,B81,B82,B83,B86,B87,B88,B9,B90,B95,B96,B98,B99,C1,C10,C12,C14,C16,C18,C19,C2,C21,C22,C23,C25,C26,C27,C29,C3,C30,C31,C33,C34,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C43,C44,C47,C49,C51,C52,C55,C59,C6,C60,C62,C64,C65,C66,C67,C71,C72,C73,C74,C76,C79,C8,C80,C81,C84,C85,C87,D1,D11,D2,D3,D4,D5,D7,D8 |
Chr8:35590462 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B21,B52,C55 |
Chr8:35590514 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B40,C47,D10 |
Chr8:35590523 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B65,D6 |
Chr8:35590529 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C35 |
Chr8:35590653 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B107,B65,D6 |
Chr8:35590739 |
AT |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 11 | A1,A3,B137,B25,B6,B69,B73,C2,C41,C67,C77 |
Chr8:35590764 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B107,B65,D6 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。