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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003403`

染色体: Chr08 坐标: 35931912-35933348 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003403`
名称	SmilChr08G003403
描述	uncharacterized SmilChr08G003403
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	35931912 - 35933348 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997950`
GeneID	`130997950`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997950`
原始查询	`LOC130997950`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DUF868 family protein (DUF868) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817323]; symbol=AT2G27770; hit=AT2G27770; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	DUF868 family protein (DUF868) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817323]; symbol=AT2G27770; hit=AT2G27770; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G27770` (AT2G27770) DUF868 family protein (DUF868) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817323] identity=42.2; qcov=1.07; evalue=3.07e-81; confidence=medium
Rice	`Os03g0806700` - identity=34.9; qcov=0.879; evalue=1.78e-49; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05910 (DUF868)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997950

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779370.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057779370.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779370.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779370.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779370.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:35932171`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,C26
`Chr8:35932227`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,B126,B46,C2,C81
`Chr8:35932252`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr8:35932272`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C82
`Chr8:35932293`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	B17,B19,B9,C34,C53,C56
`Chr8:35932332`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,B102
`Chr8:35932350`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,B102
`Chr8:35932484`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	13	B131,B136,B15,B17,B2,B23,B34,B35,B47,B85,B9,C37,D3
`Chr8:35932499`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr8:35932573`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779370.1

306 aa

153

306

DUF868

PF05910 DUF868 41-303 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779370.1`	Pfam	`PF05910`	DUF868	Family	41	303	2.1e-73	248.0	Plant protein of unknown function (DUF868)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923387.1
GCGACAGATTCTCGATAAATATGAGATGACCTGTCCAATAACTGGGATTTCTTCTTCACTCCAAATTTTCGCTTTCTTTTTGCAGTTACAAACACTCCTCCAAAAAAGACTGTTGCAGAAGAAAGGCACAAAACTGCAGTTTCCTTCCCTCAAAGGCAAAGAACACACACACACACACGCACCGATGTTCAATTCATCTCTTCCTCTCCAATTCTGATCCAAAAAAAGAATGAAAAACATCGCGATATGCTACAGCGAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997950
ATGAAAAACATCGCGATATGCTACAGCGAGCACGCGATCAAAGTGTCGGATTCGTACTGCTCCGGCGCCGCATCAAATCACGCCCACACCTCATCATCTCTCTCCGCCTCCGCCCCTTCAATCCAAACCGCCGTCACCTCCATTTACAAAGTCAAACTCTCCAATGAGAAGCAGTTTCTGATCAGAATCGGCTGGTGCAATCCGGCGATGAATCACGCCTTCTCCATCACCATCTCCGACTACCCGTTTTCCACCGCCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779370.1
MKNIAICYSEHAIKVSDSYCSGAASNHAHTSSSLSASAPSIQTAVTSIYKVKLSNEKQFLIRIGWCNPAMNHAFSITISDYPFSTAKLSRSFMILRRQRGSEDLESAGLRADVFWDLRRARFETGPEPVSGFYMAVLINSELALVLGDMEQEVLIEAKKCVSDNSTVPELSLISRGERFSGGGVYAARAKFSEAGAWHDIVIRFCGTTSSRGSLLCVYVDGKSVVEVKRVQWNFRGNQSIFLDGLLIDLMWDVHDWVFNP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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