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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003405`

染色体: Chr08 坐标: 35968398-35970867 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003405`
名称	SmilChr08G003405
描述	fructose-bisphosphate aldolase 6, cytosolic-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	35968398 - 35970867 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997952`
GeneID	`130997952`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997952`
原始查询	`LOC130997952`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	fructose-bisphosphate aldolase 6, cytosolic-like
产物	fructose-bisphosphate aldolase 6%2C cytosolic-like
Arabidopsis	`AT3G52930` (FBA8) Aldolase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824459] identity=84.4; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0905800` (AldC-1) - identity=83; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004332 (fructose-bisphosphate aldolase activity); GO:0005829 (cytosol); GO:0006096 (glycolytic process); GO:0030388 (fructose 1,6-bisphosphate metabolic process)
KEGG	smil00010 (Glycolysis / Gluconeogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00030 (Pentose phosphate pathway - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00051 (Fructose and mannose metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00710 (Carbon fixation by Calvin cycle - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01200 (Carbon metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01230 (Biosynthesis of amino acids - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00274 (Glycolytic)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997952

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057779371.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057779371.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779371.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779371.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779371.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:35969980`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	74	A11,A14,A16,A21,A3,A5,A7,A9,B10,B101,B102,B103,B106,B107,B11,B115,B12,B123,B128,B133,B134,B136,B137,B14,B17,B18,B2,B20,B21,B23,B27,B32,B35,B4,B53,B54,B62,B68,B69,B7,B73,B74,B75,B76,B78,B82,B86,B91,B98,C13,C14,C16,C23,C24,C25,C27,C33,C37,C40,C42,C44,C48,C50,C52,C54,C60,C65,C7,C73,C78,C85,C86,C9,D7
`Chr8:35970093`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C26
`Chr8:35970174`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr8:35970244`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,D11
`Chr8:35970261`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:35970354`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,B136
`Chr8:35970429`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A25,B37,C82
`Chr8:35970459`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr8:35970569`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B76
`Chr8:35970569`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779371.1

358 aa

179

358

Glycolytic

PF00274 Glycolytic 11-358 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779371.1`	Pfam	`PF00274`	Glycolytic	Domain	11	358	1.7e-173	577.0	Fructose-bisphosphate aldolase class-I

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923388.1
AGGGGTCGAAGATGTGGGCGAAATTATCGATGAATCAATACCCCCCCTCCCCCATGTTATAAAATCCCTACCCCCACCCCTTTCTACACATCTTCCACCAAAGTCTCATTTCTGTCTGCGTTTTTCATTTCTTCCCTTTTTCTTCACTTAATATATTGAAGCTGCAACCATGACTGCCTACCGCGGAAAGTACGCTGATGAGCTTATTGCCAATGCTTCATACATTGGTACCCCTGGGAAGGGTATTCTTGCTGCTGATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997952
ATGACTGCCTACCGCGGAAAGTACGCTGATGAGCTTATTGCCAATGCTTCATACATTGGTACCCCTGGGAAGGGTATTCTTGCTGCTGATGAATCAACTGGAACAATTGGCAAGCGTTTATCGAGCATCAATGTTGAGAACATTGAGGCTAACAGGAGGGCTCTACGTGAACTTCTTTTCTGCGCTCCTGGTGCCCTTCAATACCTGAGTGGTGTGATCCTTTTTGAGGAAACTCTGTACCAGAAAACTGCTGCAGGCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779371.1
MTAYRGKYADELIANASYIGTPGKGILAADESTGTIGKRLSSINVENIEANRRALRELLFCAPGALQYLSGVILFEETLYQKTAAGKPFVDVLNEGGVLPGIKVDKGTVELAGTNGETTTQGLDGLAQRCQQYYAAGARFAKWRAVLKIGANEPSALAINDNANGLARYAIICQENGLVPIVEPEILVDGSHDINKCAEVTERVLAACYKALNDHHVLLEGTLLKPNMVTPGSDAPKVTPEVVAEYTVRALQRTMPPAVP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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