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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003797`

染色体: Chr08 坐标: 43874007-43886537 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003797`
名称	SmilChr08G003797
描述	probable glycosyltransferase At5g03795
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	43874007 - 43886537 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997964`
GeneID	`130997964`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997964`
原始查询	`LOC130997964`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable glycosyltransferase At5g03795
产物	probable glycosyltransferase At5g03795
Arabidopsis	`AT4G38040` (AT4G38040) Exostosin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829960] identity=40.6; qcov=0.794; evalue=2.76e-89; confidence=medium
Rice	`Os02g0187200` - identity=39.4; qcov=0.774; evalue=6.11e-83; confidence=medium
GO	GO:0006486 (GO:0006486); GO:0016757 (glycosyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF03016 (Exostosin_GT47)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997964

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057779382.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057779382.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779382.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779382.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779382.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:43881517`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr8:43881521`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,B128
`Chr8:43881678`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,B49,C32,C68
`Chr8:43881734`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:43881805`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	B113,B45,C25,C34,C63,C67
`Chr8:43884014`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B49,C32,C68
`Chr8:43884137`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B67
`Chr8:43884137`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B67
`Chr8:43886269`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B41,B71,B89,C70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779382.1

472 aa

236

472

Exostosin_GT47

PF03016 Exostosin_GT47 144-422 aa

XP_057779383.1

465 aa

232

465

Exostosin_GT47

PF03016 Exostosin_GT47 137-415 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779382.1`	Pfam	`PF03016`	Exostosin_GT47	Domain	144	422	1.8e-68	231.8	Exostosin GT47 domain
`XP_057779383.1`	Pfam	`PF03016`	Exostosin_GT47	Domain	137	415	1.7e-68	231.9	Exostosin GT47 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923400.1
CCAGTATAGTTTTTGCAGGGCATGGCGGCCTCCGCCGGCTTCTTCACTCCGCCGCCGCCGCCGTCGTTTTTCCGCCGCCTGCAGAAAGATTCATTCCAAGGCCTATTCTTCCTGCTCATAGCCAGCTCGATTTTCTTCTTTTTCTATTCATTTTCCAGCATAAAACTTGAGATTAATCAGCAAGAAGGCCTAATTCACCCTCCTAAAGCTATCATACCACTTCAACAACCACACCAAGCTGTGCACAACCACCCTTTCAT...

XM_057923399.1
TATTGAATACATTTAAAATCTTTAACATATCAAGACCTTATTTCGAAATGAAATTAATTACCCGATTATACAATTACCATCTGACAAAAGAATCTTGTACGTACTTTCAAAATCCCAACAGATAAAGAAAAAAATTTACATTATCCTTTGAAATAAACTTAAAGCAGCCAACACCAACTTATGGTTCAAATTAAAAAGGGCATGGCGGCCTCCGCCGGCTTCTTCACTCCGCCGCCGCCGCCGTCGTTTTTCCGCCGCCT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130997964
ATGGTTCAAATTAAAAAGGGCATGGCGGCCTCCGCCGGCTTCTTCACTCCGCCGCCGCCGCCGTCGTTTTTCCGCCGCCTGCAGAAAGATTCATTCCAAGGCCTATTCTTCCTGCTCATAGCCAGCTCGATTTTCTTCTTTTTCTATTCATTTTCCAGCATAAAACTTGAGATTAATCAGCAAGAAGGCCTAATTCACCCTCCTAAAGCTATCATACCACTTCAACAACCACACCAAGCTGTGCACAACCACCCTTTCAT...

LOC130997964
ATGGCGGCCTCCGCCGGCTTCTTCACTCCGCCGCCGCCGCCGTCGTTTTTCCGCCGCCTGCAGAAAGATTCATTCCAAGGCCTATTCTTCCTGCTCATAGCCAGCTCGATTTTCTTCTTTTTCTATTCATTTTCCAGCATAAAACTTGAGATTAATCAGCAAGAAGGCCTAATTCACCCTCCTAAAGCTATCATACCACTTCAACAACCACACCAAGCTGTGCACAACCACCCTTTCATCTCTCAAGAATTGCAAGACGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057779382.1
MVQIKKGMAASAGFFTPPPPPSFFRRLQKDSFQGLFFLLIASSIFFFFYSFSSIKLEINQQEGLIHPPKAIIPLQQPHQAVHNHPFISQELQDDVILPEKEVVATSKGGAGDRETPGHGESVTGSRNDDAFHERSVFMEEYEEMNKSMKIYVYPHNKSDPFANVLLPVDSEPGGNYASESYFKKALFNSHFLTNDPWEADLFYLPFSIASLRHDKRIGVGGIQTYIRNYVRDISRAYPFWNRTGGADHFYVACHSVGRTA...

XP_057779383.1
MAASAGFFTPPPPPSFFRRLQKDSFQGLFFLLIASSIFFFFYSFSSIKLEINQQEGLIHPPKAIIPLQQPHQAVHNHPFISQELQDDVILPEKEVVATSKGGAGDRETPGHGESVTGSRNDDAFHERSVFMEEYEEMNKSMKIYVYPHNKSDPFANVLLPVDSEPGGNYASESYFKKALFNSHFLTNDPWEADLFYLPFSIASLRHDKRIGVGGIQTYIRNYVRDISRAYPFWNRTGGADHFYVACHSVGRTAMNKAVQV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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