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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000622`

染色体: Chr08 坐标: 4650150-4650707 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000622`
名称	SmilChr08G000622
描述	uncharacterized SmilChr08G000622
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	4650150 - 4650707 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997977`
GeneID	`130997977`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997977`
原始查询	`LOC130997977`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814794]; symbol=AT2G02650; hit=AT2G02650; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814794]; symbol=AT2G02650; hit=AT2G02650; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G02650` (AT2G02650) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814794] identity=32.3; qcov=0.686; evalue=6.2e-13; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=28.5; qcov=0.854; evalue=1.23e-10; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997977

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057779398.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057779398.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779398.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779398.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779398.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:4650228`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B5,B96,C87
`Chr8:4650251`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B5,B74,B96,C87
`Chr8:4650312`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	B105,B53,B62,B7,B83,C28,C62,D8
`Chr8:4650320`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B35,B77
`Chr8:4650352`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C12,C59
`Chr8:4650362`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B53,B62,B7,B83
`Chr8:4650392`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B105,B62,B83
`Chr8:4650392`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B105,B62,B83
`Chr8:4650405`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr8:4650411`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B84,D11
`Chr8:4650419`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr8:4650440`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	A3,B11,B135,B68,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779398.1

185 aa

185

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 15-84 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779398.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	15	84	2.4e-17	64.1	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923415.1
ATGATTCACCTATCCTGTGCAACTGTGGAACTAGGTGTTGCAGAGCTCGATATCATTTGGAGTGCACCGACTCCACCCAAAGTCATTACAACGGCTTGGAGAGCGCTGAAAGGTAAGATGCCTACGTGCGATAATCTTTTGAAAAGAAACATTGCCATTCCCCCTTTGGAGTCGTTATGTGTCCTCTGTAAGATGGAGGTCGAGACAACGGATCATATCTTCTTCAAATGTGAAAGCTCTTCCGCGATTTGGACTGACGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997977
ATGATTCACCTATCCTGTGCAACTGTGGAACTAGGTGTTGCAGAGCTCGATATCATTTGGAGTGCACCGACTCCACCCAAAGTCATTACAACGGCTTGGAGAGCGCTGAAAGGTAAGATGCCTACGTGCGATAATCTTTTGAAAAGAAACATTGCCATTCCCCCTTTGGAGTCGTTATGTGTCCTCTGTAAGATGGAGGTCGAGACAACGGATCATATCTTCTTCAAATGTGAAAGCTCTTCCGCGATTTGGACTGACGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779398.1
MIHLSCATVELGVAELDIIWSAPTPPKVITTAWRALKGKMPTCDNLLKRNIAIPPLESLCVLCKMEVETTDHIFFKCESSSAIWTDVAFWLGKNTALHCKVRDHFNAFINLGDKKETRALLGVWAGVIWVLWKTRNECKFQQGEWNKNRVVADLKSRVWSWMNVYNISKSPCEFRRWFLAANFNT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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