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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000660`

染色体: Chr08 坐标: 4894143-4900359 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000660`
名称	SmilChr08G000660
描述	transcription factor E2FB-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	4894143 - 4900359 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997978`
GeneID	`130997978`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997978`
原始查询	`LOC130997978`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor E2FB-like
产物	transcription factor E2FB-like
Arabidopsis	`AT5G22220` (E2F1) E2F transcription factor 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832283] identity=52.9; qcov=0.796; evalue=7.08e-144; confidence=high
Rice	`Os02g0537500` (OsE2F1) - identity=56.4; qcov=0.656; evalue=5.93e-132; confidence=high
GO	GO:0000978 (RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding); GO:0000981 (DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II); GO:0046983 (protein dimerization activity); GO:0090575 (RNA polymerase II transcription regulator complex)
KEGG	-
Pfam	PF02319 (WHD_E2F_TDP); PF16421 (E2F_CC-MB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997978

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779400.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779400.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779400.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779400.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057779400.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:4894489`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,B9
`Chr8:4894531`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	45	A10,A11,A20,A23,A4,B111,B112,B119,B120,B133,B135,B136,B17,B27,B3,B30,B41,B5,B67,B7,B73,B81,B82,B84,B91,B93,B98,C13,C14,C18,C28,C3,C32,C37,C41,C49,C53,C59,C68,C7,C74,C76,C81,C83,D9
`Chr8:4894682`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr8:4895218`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,B16,C9
`Chr8:4895890`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr8:4896053`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B117,B2,C12
`Chr8:4896060`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B134,B31
`Chr8:4896709`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	20	A7,B1,B105,B18,B22,B30,B40,B56,B58,B6,B67,B81,B99,C13,C21,C32,C52,C65,C71,C75
`Chr8:4896712`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	A14,B134,B71,C17,C30
`Chr8:4896712`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	5	A14,B134,B71,C17,C30
`Chr8:4896720`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B40,B58,B81,C21,C75
`Chr8:4897201`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779400.1

598 aa

299

598

WHD_E2F_TDP

E2F_CC-MB

PF02319 WHD_E2F_TDP 252-315 aa PF16421 E2F_CC-MB 331-431 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779400.1`	Pfam	`PF02319`	WHD_E2F_TDP	Domain	252	315	1.5e-27	95.8	E2F/DP family winged-helix DNA-binding domain
`XP_057779400.1`	Pfam	`PF16421`	E2F_CC-MB	Domain	331	431	4.6e-34	117.1	E2F transcription factor CC-MB domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923417.1
ATGTCAAGCGGCGTTGTGGTTCCCTCCACATCTATATCCGAACCAAATTCCCTCCTTCCTTTCTCTCTCTCTATCTTTCCCTCGTTTTCTTCTCCATTTTCTTTCCCTCTTTTTTATTGCTGTCTCTCCCAAATCAGATCTCTCCAAACCCTCACTTCCATTCTGCTCCCAATTCTCATCACCTTCCACAATTCTATTCCTTTTTCCCCCATTCGATTTCATTCCCTCTCAAACCCCAAAAACCTCAGAGATCAATTCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997978
ATGTCAAGCGGCGTTGTGGTTCCCTCCACATCTATATCCGAACCAAATTCCCTCCTTCCTTTCTCTCTCTCTATCTTTCCCTCGTTTTCTTCTCCATTTTCTTTCCCTCTTTTTTATTGCTGTCTCTCCCAAATCAGATCTCTCCAAACCCTCACTTCCATTCTGCTCCCAATTCTCATCACCTTCCACAATTCTATTCCTTTTTCCCCCATTCGATTTCATTCCCTCTCAAACCCCAAAAACCTCAGAGATCAATTCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779400.1
MSSGVVVPSTSISEPNSLLPFSLSIFPSFSSPFSFPLFYCCLSQIRSLQTLTSILLPILITFHNSIPFSPIRFHSLSNPKNLRDQFLRAGIDYKIREFFRFVEVFLSSKERDRIMQRQTPPPPSSRKQLPFTSMKPPFGGGGGGGGGDYHHFASGDAQRPDHEFVESVAVKKRPPLKRKSGVAEPEVEPADHNASPGNVTVPKGPFQTPPSAKSGKQKVSRSKANKAGSQIPIPNVGSPSGNHTPVGPCRYDSSLGLLTK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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