当前解析结果
SmilChr08G000798| 统一新 Gene ID | SmilChr08G000798 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G000798 |
| 描述 | glycine-rich cell wall structural protein-like |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 5861885 - 5862445 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130997986 |
|---|---|
| GeneID | 130997986 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130997986 |
| 原始查询 | LOC130997986 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | glycine-rich cell wall structural protein-like |
| 产物 | glycine-rich cell wall structural protein-like |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130997986 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Secreted | 分泌到胞外 | 0.60000 | XP_057779407.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057779407.1 |
| 3 | Vacuole | 液泡 | 0.20000 | XP_057779407.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057779407.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057779407.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:5861890 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B107 |
Chr8:5861957 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A1,B127 |
Chr8:5861960 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C12 |
Chr8:5861984 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 179 | A1,A10,A13,A14,A16,A18,A2,A20,A21,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B10,B100,B101,B103,B104,B105,B106,B107,B108,B109,B11,B111,B112,B113,B118,B120,B122,B123,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B131,B133,B134,B135,B136,B14,B140,B15,B18,B19,B21,B22,B23,B24,B25,B26,B28,B29,B30,B31,B33,B34,B36,B37,B38,B39,B40,B44,B45,B49,B51,B55,B56,B58,B60,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B69,B7,B72,B73,B74,B75,B79,B8,B80,B82,B83,B84,B85,B86,B88,B89,B90,B92,B93,B95,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C2,C20,C21,C22,C25,C27,C28,C29,C3,C31,C33,C34,C35,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C43,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C53,C54,C55,C56,C57,C60,C62,C64,C66,C69,C7,C71,C72,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C8,C80,C82,C87,C9,D1,D11,D2,D3,D4,D5,D7,D9 |
Chr8:5862070 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B140 |
Chr8:5862181 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B54,C25,C29 |
Chr8:5862420 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B84 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。