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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000799`

染色体: Chr08 坐标: 5864602-5867455 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000799`
名称	SmilChr08G000799
描述	uncharacterized SmilChr08G000799
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	5864602 - 5867455 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997987`
GeneID	`130997987`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997987`
原始查询	`LOC130997987`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	D-Tyr-tRNA(Tyr) deacylase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827578]; symbol=AT4G18460; hit=AT4G18460; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	D-Tyr-tRNA(Tyr) deacylase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827578]; symbol=AT4G18460; hit=AT4G18460; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G18460` (AT4G18460) D-Tyr-tRNA(Tyr) deacylase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827578] identity=83.3; qcov=0.592; evalue=2.72e-46; confidence=medium
Rice	`Os01g0242500` - identity=81.5; qcov=0.57; evalue=9.38e-46; confidence=medium
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006399 (tRNA metabolic process); GO:0051500 (D-tyrosyl-tRNA(Tyr) deacylase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02580 (Tyr_Deacylase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997987

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057779408.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057779408.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057779408.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779408.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779408.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:5864686`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr8:5864693`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B139
`Chr8:5864693`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B139
`Chr8:5865013`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr8:5865014`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	C24,D4
`Chr8:5865014`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	C24,D4
`Chr8:5865208`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	29	A10,A19,A20,A23,B109,B11,B112,B12,B123,B140,B22,B24,B25,B56,B78,B84,B88,B90,B92,B96,B99,C15,C34,C49,C56,C61,C72,C82,C87
`Chr8:5865776`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr8:5865881`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B135,B138,C1,C46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779408.1

142 aa

142

Tyr_Deacylase

PF02580 Tyr_Deacylase 59-138 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779408.1`	Pfam	`PF02580`	Tyr_Deacylase	Domain	59	138	1.7e-26	94.0	D-Tyr-tRNA(Tyr) deacylase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923425.1
ATGATAATAGACGACACAACTCTGTTCCACCTAGACCACCCCCACCTCGCCTCGCCGCGCTGCTGCGCCTCTCCTCGCTGCGCCGTGTATTGCTGCTCCTCGCCTCGCCTCGCCGTCGATTGCTGCGTCTCGACTCGCCATCGATTGCTGCCACCCATTGTCGTAATAAATTTGGTTATGCAAAAAAATTATGAAGTTCTATTAGTAAGTCAGTTTACATTATATGGGGTATTAAAAGGAAACAAACCTGATTTTCATGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997987
ATGATAATAGACGACACAACTCTGTTCCACCTAGACCACCCCCACCTCGCCTCGCCGCGCTGCTGCGCCTCTCCTCGCTGCGCCGTGTATTGCTGCTCCTCGCCTCGCCTCGCCGTCGATTGCTGCGTCTCGACTCGCCATCGATTGCTGCCACCCATTGTCGTAATAAATTTGGTTATGCAAAAAAATTATGAAGTTCTATTAGTAAGTCAGTTTACATTATATGGGGTATTAAAAGGAAACAAACCTGATTTTCATGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779408.1
MIIDDTTLFHLDHPHLASPRCCASPRCAVYCCSSPRLAVDCCVSTRHRLLPPIVVINLVMQKNYEVLLVSQFTLYGVLKGNKPDFHVAMPPAAAKSFYASLVERFQKAYGADAVKDGLFGAMMTVNLVNDGPVTMQLESRES

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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