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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000872`

染色体: Chr08 坐标: 6469401-6470078 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000872`
名称	SmilChr08G000872
描述	uncharacterized SmilChr08G000872
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	6469401 - 6470078 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997993`
GeneID	`130997993`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997993`
原始查询	`LOC130997993`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030]; symbol=AT4G29090; hit=AT4G29090; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030]; symbol=AT4G29090; hit=AT4G29090; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G29090` (AT4G29090) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030] identity=25; qcov=0.853; evalue=1.18e-10; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=26.5; qcov=0.822; evalue=1.48e-08; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997993

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057779415.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057779415.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057779415.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779415.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779415.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:6469408`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	65	A1,A10,A14,A23,A4,B103,B105,B11,B110,B114,B119,B122,B123,B125,B13,B131,B137,B139,B16,B17,B20,B21,B25,B28,B3,B32,B47,B57,B63,B7,B72,B73,B74,B79,B85,B90,B93,B98,C12,C16,C20,C21,C22,C25,C26,C28,C29,C3,C30,C33,C36,C37,C39,C40,C46,C5,C63,C67,C73,C8,C81,C84,C87,D3,D6
`Chr8:6469413`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	60	A1,A10,A14,A4,B103,B105,B11,B110,B114,B119,B122,B125,B13,B131,B137,B139,B16,B17,B18,B20,B21,B28,B3,B32,B47,B57,B63,B7,B72,B73,B74,B79,B85,B90,B93,B98,C12,C16,C20,C21,C25,C26,C28,C29,C3,C30,C33,C36,C37,C39,C40,C46,C5,C63,C67,C73,C8,C81,C87,D3
`Chr8:6469440`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	66	A1,A10,A14,A24,A7,B1,B103,B105,B110,B114,B119,B120,B122,B125,B127,B13,B131,B134,B135,B137,B139,B17,B18,B21,B28,B3,B31,B32,B47,B63,B69,B72,B73,B74,B80,B85,B90,B91,B98,C10,C12,C16,C19,C20,C22,C25,C26,C28,C3,C30,C34,C36,C37,C40,C46,C48,C63,C67,C69,C71,C75,C8,C83,C87,C9,D3
`Chr8:6469443`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	41	A11,A13,A19,A25,A5,A8,B109,B112,B121,B126,B127,B128,B132,B23,B24,B44,B53,B56,B58,B64,B78,B9,B91,B92,B96,B97,C15,C27,C31,C4,C44,C45,C53,C57,C68,C72,D10,D11,D2,D5,D9
`Chr8:6469459`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	16	A11,A19,B126,B44,B53,B58,B64,B91,B92,B97,C15,C45,C57,C68,D10,D9
`Chr8:6469466`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	16	A11,A19,B126,B44,B53,B58,B64,B91,B92,B97,C15,C45,C57,C68,D10,D9
`Chr8:6469472`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	46	A11,A14,A19,B1,B105,B11,B110,B120,B122,B134,B137,B139,B17,B20,B3,B31,B4,B44,B47,B53,B64,B69,B74,B85,B90,B91,B92,B93,B97,B98,C12,C15,C19,C25,C28,C29,C34,C36,C45,C48,C57,C58,C68,D10,D3,D9
`Chr8:6469485`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B7,B92,C21
`Chr8:6469485`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B7,B92,C21
`Chr8:6469492`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B136,B49,B50,C36
`Chr8:6469536`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	A6,A8,B75,B99,C10,C35,C75
`Chr8:6469574`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B31,C1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779415.1

225 aa

112

225

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 29-120 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779415.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	29	120	3.2e-16	60.5	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923432.1
ATGACTCTTCGATTTGTTTCTGCTTTTGTCCCTCGTACAGGTTCAACTGACGGATGGAGTTGGAAGGCAACAACCGATGGCAACTTCACAACAAAGTCGGCATATGAATTGTTGGAGGCAACCAGAGAGGAGCAACAGGTCCAACCGTTAGAGATGGCTAAAGTGTGGGAAGCCCCAACGTCACATAAAGCCAAGGTGACAGCGTGGAGATGTCTTAGAAACCGCTTGGCAACCTGCGACAATTTGAGAAGAAGAAATAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997993
ATGACTCTTCGATTTGTTTCTGCTTTTGTCCCTCGTACAGGTTCAACTGACGGATGGAGTTGGAAGGCAACAACCGATGGCAACTTCACAACAAAGTCGGCATATGAATTGTTGGAGGCAACCAGAGAGGAGCAACAGGTCCAACCGTTAGAGATGGCTAAAGTGTGGGAAGCCCCAACGTCACATAAAGCCAAGGTGACAGCGTGGAGATGTCTTAGAAACCGCTTGGCAACCTGCGACAATTTGAGAAGAAGAAATAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779415.1
MTLRFVSAFVPRTGSTDGWSWKATTDGNFTTKSAYELLEATREEQQVQPLEMAKVWEAPTSHKAKVTAWRCLRNRLATCDNLRRRNIQISWEERWCNACVAGKETTEHLILHCPKASVVWDQIFQWLHIKTANPRGILQHFTSFISAAKIKKGRRLLIALWVGIVWMLWENRNESRFQGKVWDIDRCVLQIKGRLWSWNEAYKILELGIPFTLWCSKGFNLSFLF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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