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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003921`

染色体: Chr01 坐标: 57468112-57474680 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003921`
名称	SmilChr01G003921
描述	aspartic proteinase 36-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	57468112 - 57474680 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997996`
GeneID	`130997996`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997996`
原始查询	`LOC130997996`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aspartic proteinase 36-like
产物	aspartic proteinase 36-like
Arabidopsis	`AT1G05840` (AT1G05840) Eukaryotic aspartyl protease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837094] identity=67.3; qcov=0.946; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0473200` (OsAP19) - identity=56.2; qcov=0.932; evalue=4.87e-177; confidence=high
GO	GO:0004190 (aspartic-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00026 (Asp); PF14541 (TAXi_C); PF14543 (TAXi_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997996

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057779421.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057779421.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779421.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779421.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779421.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:57468375`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr1:57468408`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr1:57468557`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B69,B73,C46,C84
`Chr1:57469674`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	41	A1,A23,A9,B1,B100,B132,B134,B14,B17,B18,B19,B23,B27,B28,B32,B35,B36,B40,B45,B48,B52,B54,B61,B65,B70,B83,B93,C38,C4,C55,C56,C58,C60,C78,C79,C81,C84,C9,D4,D5,D8
`Chr1:57469688`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B92,C20
`Chr1:57469719`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B1,B36
`Chr1:57469719`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B1,B36
`Chr1:57470128`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B29
`Chr1:57473493`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779421.1

485 aa

242

485

TAXi_N

Asp

TAXi_C

PF14543 TAXi_N 83-265 aa PF00026 Asp 83-434 aa PF14541 TAXi_C 283-434 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779421.1`	Pfam	`PF14543`	TAXi_N	Domain	83	265	6.5e-38	131.4	Xylanase inhibitor N-terminal
`XP_057779421.1`	Pfam	`PF00026`	Asp	Domain	83	434	8.6e-21	75.4	Eukaryotic aspartyl protease
`XP_057779421.1`	Pfam	`PF14541`	TAXi_C	Domain	283	434	3.8e-17	63.3	Xylanase inhibitor C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923438.1
TGAAAGCCTGCCCAACACTATCATCATATTCGTATCAAATTCGAGTATCGAGTTCAGATTCTAACAAGCCTTTTTGATCTGTATTACAGAATCGGACATTTCAAAGTTTGAACAAAGTTAATTACGAGACAAAAATACCCCCAAATAATATTTAAAAATAAATAAATAATACGACAATCATCACTAGACGAACGACTTCTGCAGCAGAAACCCAGAACAGAAGGTGAGAAACACAGAAAATGGCGCCGCGCTTCCGCTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997996
ATGGCGCCGCGCTTCCGCTCTCTACTGCTCCTCCTTCTCCCGCCGCTCCTCAATTTTCTCTCTCTCAATCCAGTCTGCGGAAGCGGCGGCGGCGCCACCGGAGTCATCAAAGTGAATTACAAATTCGCCGGCTCCGACGCCAGTCTCAGCACCCTCAGAGCTCACGATGATATCCGCCACCTCTCCATTCTCGCCGGCGTCGACCTGCCCCTCGGTGGAACCGGTCGTCCTGACGCGTCCGGGCTCTACTATGCTAAAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779421.1
MAPRFRSLLLLLLPPLLNFLSLNPVCGSGGGATGVIKVNYKFAGSDASLSTLRAHDDIRHLSILAGVDLPLGGTGRPDASGLYYAKIGIGTPSKDYYVQVDTGTDITWVNCIQCHQCPRRGYHGIELPLYNPKDSLTGKLVSCDQDFCKEIGGGLSGCNANSSCLYTEVYGDGSYTIGYFVEDVVQYDRISGDLQTKSANGSVIFGCGAQQSGDLGPSDDALNGILGFGKSNSSMLSQLASSGRVKKMFAHCLDGVNGGG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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