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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001019`

染色体: Chr08 坐标: 7712769-7714169 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001019`
名称	SmilChr08G001019
描述	uncharacterized SmilChr08G001019
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	7712769 - 7714169 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998011`
GeneID	`130998011`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998011`
原始查询	`LOC130998011`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT1G43760` (AT1G43760) DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840968] identity=25.3; qcov=0.807; evalue=1.16e-23; confidence=low
Rice	`Os06g0484800` - identity=24.5; qcov=0.815; evalue=6.17e-27; confidence=weak
GO	GO:0003824 (catalytic activity)
KEGG	-
Pfam	PF03372 (Exo_endo_phos); PF14529 (Exo_endo_phos_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998011

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057779432.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057779432.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057779432.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779432.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779432.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:7712919`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A11
`Chr8:7712919`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A11
`Chr8:7712983`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr8:7713011`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C41
`Chr8:7713083`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C41,C56,C75
`Chr8:7713089`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C41,C56,C75
`Chr8:7713093`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C56,C75
`Chr8:7713095`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C56,C75
`Chr8:7713098`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,C41,C56,C75
`Chr8:7713099`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C4,C48
`Chr8:7713100`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	C41,C56,C75
`Chr8:7713100`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	3	C41,C56,C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779432.1

466 aa

233

466

Exo_endo_phos

Exo_endo_phos_2

PF03372 Exo_endo_phos 4-227 aa PF14529 Exo_endo_phos_2 105-231 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779432.1`	Pfam	`PF03372`	Exo_endo_phos	Domain	4	227	7.1e-16	59.3	Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family
`XP_057779432.1`	Pfam	`PF14529`	Exo_endo_phos_2	Domain	105	231	2.9e-09	37.5	Endonuclease-reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923449.1
ATGAATTTGTTATCTTATAACATTCGGGGCTTGGGGAGTGTTGCGAAGCAGAGAGATGTTACTGATTTGGTGAAAGGGCAGAAGATCGATTTTTGTTGCTTACAGGAGACAAAGATGGAGGTGTTTAGGGACTTGTTCTGTAAATCTTGGTGGGGGTCTAATTATACAGACATAGCGATTAGGAATTCGGAGGGAAGGGCTGGAGGAATTGTTTGCTTGTGGAATAGGGAGGTGTTCGAAGCCTCTAGTACGTGGGATTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998011
ATGAATTTGTTATCTTATAACATTCGGGGCTTGGGGAGTGTTGCGAAGCAGAGAGATGTTACTGATTTGGTGAAAGGGCAGAAGATCGATTTTTGTTGCTTACAGGAGACAAAGATGGAGGTGTTTAGGGACTTGTTCTGTAAATCTTGGTGGGGGTCTAATTATACAGACATAGCGATTAGGAATTCGGAGGGAAGGGCTGGAGGAATTGTTTGCTTGTGGAATAGGGAGGTGTTCGAAGCCTCTAGTACGTGGGATTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779432.1
MNLLSYNIRGLGSVAKQRDVTDLVKGQKIDFCCLQETKMEVFRDLFCKSWWGSNYTDIAIRNSEGRAGGIVCLWNREVFEASSTWDLPGAVVVNGRYKEGDILCCIINVYAPVGSGEKRILWDALSSIVEQNTDRSVCILGDFNSVRRRDERVGSGEAFGVADARSFEEFIRGNDLEEIKTQGRKFTWYKPNGKCKSKIDRFLVNENWLAAWEGTSARGLQRSISDHCPIILTTRSEDWGPRPFRFLNAWVNHSEFEEMV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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