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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001068`

染色体: Chr08 坐标: 8236308-8237711 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001068`
名称	SmilChr08G001068
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-3
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	8236308 - 8237711 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998016`
GeneID	`130998016`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998016`
原始查询	`LOC130998016`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-3
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-3
Arabidopsis	`AT1G59780` (AT1G59780) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842271] identity=23.9; qcov=0.994; evalue=3.64e-15; confidence=weak
Rice	`Os10g0136100` - identity=25.6; qcov=0.946; evalue=3.89e-14; confidence=low
GO	GO:0006457 (protein folding); GO:0043014 (alpha-tubulin binding)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998016

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779437.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057779437.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057779437.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779437.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779437.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:8236316`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111
`Chr8:8236323`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	B110,B129,B136,B20,B7,B76,B98,C18,C45,C48,C63,C65
`Chr8:8236343`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B62,C10
`Chr8:8236365`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14
`Chr8:8236416`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,A22,B30,B33,B70
`Chr8:8236439`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	89	A10,A22,A9,B10,B101,B102,B103,B104,B106,B107,B110,B111,B112,B113,B119,B120,B123,B128,B130,B132,B137,B139,B14,B15,B26,B28,B29,B34,B38,B39,B41,B49,B51,B54,B57,B6,B60,B66,B67,B7,B71,B72,B75,B81,B83,B84,B85,B86,B87,B88,B9,B99,C11,C17,C20,C23,C24,C28,C29,C33,C37,C38,C4,C46,C47,C49,C50,C53,C56,C58,C59,C67,C69,C7,C71,C73,C75,C76,C78,C79,C80,C81,C83,C85,C86,D4,D6,D8,D9
`Chr8:8236478`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	30	A10,A18,A9,B10,B101,B103,B106,B107,B111,B119,B120,B132,B139,B26,B28,B38,B39,B66,B7,B71,B72,B75,B81,B85,B88,C17,C29,C49,C50,D4
`Chr8:8236513`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr8:8236517`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:8236544`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D11
`Chr8:8236544`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:8236547`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923454.1
ATGAATGGCAAATGTTTGAAAACTATTGGCAAAGAGTTGTTAAAGGACTTGGTTGATAGAAATCTCATTCTAGTTGATGAGTTGGGGTCTACAGGAAACATAAAATCAGTCAAAATTCATGATTTGTTGAGGGATTTATGCTTGAACCTGGGCCAGAGAGATGGGTTCTATCACGTGATAGGGCAATCTAGTCCTCGAGGCATACATAGCCAACGCCGCATTGTTATCCCCAGGAACACTTCGGAGAAGAAAGTCCTTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998016
ATGAATGGCAAATGTTTGAAAACTATTGGCAAAGAGTTGTTAAAGGACTTGGTTGATAGAAATCTCATTCTAGTTGATGAGTTGGGGTCTACAGGAAACATAAAATCAGTCAAAATTCATGATTTGTTGAGGGATTTATGCTTGAACCTGGGCCAGAGAGATGGGTTCTATCACGTGATAGGGCAATCTAGTCCTCGAGGCATACATAGCCAACGCCGCATTGTTATCCCCAGGAACACTTCGGAGAAGAAAGTCCTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779437.1
MNGKCLKTIGKELLKDLVDRNLILVDELGSTGNIKSVKIHDLLRDLCLNLGQRDGFYHVIGQSSPRGIHSQRRIVIPRNTSEKKVLDDLQYMSRARSIICEYGKVPQCSNYGLLRTIHAYKFRTYEDESYVNSLVSRCVNLRHLAVEVGSMSSIFSSFNHLWNLHTLIVSSRYNSTFNVPTEIWKMPQLRHIEMAERILCLPNPLNDAVVMQNLVVLEGAHNFKCDDEVVKRILNIKKLGILYSGREGIDHDDYYCLSNI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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