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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001136`

染色体: Chr08 坐标: 8924300-8924828 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001136`
名称	SmilChr08G001136
描述	agamous-like MADS-box protein AGL61
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	8924300 - 8924828 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998032`
GeneID	`130998032`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998032`
原始查询	`LOC130998032`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	agamous-like MADS-box protein AGL61
产物	agamous-like MADS-box protein AGL61
Arabidopsis	`AT3G04100` (AGL57) AGAMOUS-like 57 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819565] identity=37.1; qcov=0.924; evalue=4.3e-29; confidence=medium
Rice	`Os09g0116800` (OsMADS78) - identity=38.4; qcov=0.878; evalue=1.77e-22; confidence=medium
GO	GO:0000978 (RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding); GO:0000981 (DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II); GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF00319 (SRF-TF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998032

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779450.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779450.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779450.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779450.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057779450.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:8924329`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	111	A1,A11,A15,A18,A20,A23,A6,A8,A9,B1,B10,B103,B104,B105,B107,B108,B109,B114,B120,B122,B128,B131,B132,B133,B136,B14,B2,B22,B23,B24,B26,B28,B3,B30,B31,B33,B35,B38,B39,B4,B41,B46,B49,B5,B57,B58,B61,B63,B64,B65,B66,B68,B69,B7,B70,B73,B74,B76,B79,B82,B86,B88,B89,B91,B93,B94,B95,B98,B99,C10,C14,C15,C16,C17,C20,C22,C23,C27,C3,C30,C32,C35,C36,C41,C45,C46,C49,C50,C51,C53,C55,C61,C63,C64,C65,C66,C67,C68,C72,C73,C75,C76,C79,C8,C84,C87,C9,D1,D11,D7,D9
`Chr8:8924346`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr8:8924528`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr8:8924705`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	A23,B24,C13,C57
`Chr8:8924705`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	4	A23,B24,C13,C57

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779450.1

172 aa

172

SRF-TF

PF00319 SRF-TF 27-74 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779450.1`	Pfam	`PF00319`	SRF-TF	Domain	27	74	5e-22	77.8	SRF-type transcription factor (DNA-binding and dimerisation domain)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923467.1
TAAAAAATGAATGAAACCCAAATTACAAAAAATAATAATAATGGATGAGAAAAGAACAACAAAAGGTCGTCAAAAAATAGCGATAGCAAAAATAGAGAAAGAAAACGATTGCTACGCAACGTTTTCAAAGCGGCGGCAAGGGTTGTTCAAGAAAGGCAGCGAGCTGTCGAGCTTATGCGACGCCGACGTGGGGCTCTTGGTGTTTTCCCCGACGGGTAAGCCCTTCTCCTTCTTTCATCCTTCCATGGAGGCCGTGGTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998032
ATGAAACCCAAATTACAAAAAATAATAATAATGGATGAGAAAAGAACAACAAAAGGTCGTCAAAAAATAGCGATAGCAAAAATAGAGAAAGAAAACGATTGCTACGCAACGTTTTCAAAGCGGCGGCAAGGGTTGTTCAAGAAAGGCAGCGAGCTGTCGAGCTTATGCGACGCCGACGTGGGGCTCTTGGTGTTTTCCCCGACGGGTAAGCCCTTCTCCTTCTTTCATCCTTCCATGGAGGCCGTGGTCTCTCGGTTGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779450.1
MKPKLQKIIIMDEKRTTKGRQKIAIAKIEKENDCYATFSKRRQGLFKKGSELSSLCDADVGLLVFSPTGKPFSFFHPSMEAVVSRLGSGGAHRDDASRLLEAFSRTRVLQLNQMIDTIGEKLDDEVEREKELERERGACQKWWEMPLENLDKEQVEQLMVSMRNLQLMLRTR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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