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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001152`

染色体: Chr08 坐标: 9120695-9122155 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001152`
名称	SmilChr08G001152
描述	uncharacterized SmilChr08G001152
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	9120695 - 9122155 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998033`
GeneID	`130998033`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998033`
原始查询	`LOC130998033`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0156200; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0156200; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G01050` (AT2G01050) zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629] identity=22.3; qcov=0.471; evalue=8.15e-12; confidence=weak
Rice	`Os12g0156200` - identity=25.3; qcov=0.399; evalue=4.64e-18; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF14392 (zf-CCHC_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998033

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057779451.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057779451.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057779451.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779451.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779451.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:9120702`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B77,B84,C74
`Chr8:9120713`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr8:9120739`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr8:9120818`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,B35,B77,C71
`Chr8:9120845`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	A15,A25,B108,B117,C25,C58
`Chr8:9120849`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	C41,C64,C66
`Chr8:9120849`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	C41,C64,C66
`Chr8:9120997`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C20
`Chr8:9121049`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B41,C70,C86
`Chr8:9121053`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:9121088`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:9121115`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	29	A3,A5,B106,B107,B110,B120,B121,B129,B131,B135,B2,B25,B26,B51,B55,B60,B65,B67,B71,C11,C36,C41,C62,C64,C66,C69,C78,D1,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779451.1

486 aa

243

486

zf-CCHC_4

PF14392 zf-CCHC_4 198-226 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779451.1`	Pfam	`PF14392`	zf-CCHC_4	Domain	198	226	4.2e-07	30.2	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923468.1
ATGGATCCTGAGGAGATTGCGAGACGTGTGGCGAATTTGCGTTTGTCAATGAAGGAAACAGAGAGAGGAGTCAAACTTTCACAAGCAGACACTGAACAAAAGAATCAATGTGCAGCCAAGATGCTGGTAGGAAAGATCTTTGCAAACCGGCAATACCCCAGAGAAACATTACGCGAGAAGCTACCTTTAATTCTTCAAGTTAGAGGACATTTTGATGTTGAACTGGTGGGTTTCAATATTTTCGTCCTCTATTTGGAGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998033
ATGGATCCTGAGGAGATTGCGAGACGTGTGGCGAATTTGCGTTTGTCAATGAAGGAAACAGAGAGAGGAGTCAAACTTTCACAAGCAGACACTGAACAAAAGAATCAATGTGCAGCCAAGATGCTGGTAGGAAAGATCTTTGCAAACCGGCAATACCCCAGAGAAACATTACGCGAGAAGCTACCTTTAATTCTTCAAGTTAGAGGACATTTTGATGTTGAACTGGTGGGTTTCAATATTTTCGTCCTCTATTTGGAGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779451.1
MDPEEIARRVANLRLSMKETERGVKLSQADTEQKNQCAAKMLVGKIFANRQYPRETLREKLPLILQVRGHFDVELVGFNIFVLYLELPSDITRIMAEGPWHIFNDLILIQKLDPLQSAATVEFKNISMWIQLHNLPITCMEQEMVRKIGDKVGTVLEIESGEGGRCLGKYARVRVERSIDEPLVRGIPITSEKEDNSTMVLILYERLPESFCFACGKIGHHMKNCDAGAEEKANPSFGNWLRAGRSVDYRRPAVQNGINM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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