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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001158`

染色体: Chr08 坐标: 9216557-9217590 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001158`
名称	SmilChr08G001158
描述	aquaporin TIP1-2-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	9216557 - 9217590 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998034`
GeneID	`130998034`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998034`
原始查询	`LOC130998034`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aquaporin TIP1-2-like
产物	aquaporin TIP1-2-like
Arabidopsis	`AT4G01470` (TIP1;3) tonoplast intrinsic protein 1;3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828051] identity=75.8; qcov=0.906; evalue=1.36e-138; confidence=high
Rice	`Os01g0975900` (OsTIP1) - identity=75.4; qcov=0.906; evalue=1.2e-128; confidence=high
GO	GO:0006833 (water transport); GO:0015250 (water channel activity); GO:0016020 (membrane); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00230 (MIP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998034

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057779453.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	0.80000	`XP_057779453.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057779453.1`
4	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057779453.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779453.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:9216612`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:9216613`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B46,C39
`Chr8:9216619`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,B131
`Chr8:9216678`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B126,C57
`Chr8:9216678`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B126,C57
`Chr8:9216687`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,C19,C2,C31
`Chr8:9216693`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr8:9216699`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A18,B108,B131,B4,C77
`Chr8:9216699`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B108,B131,B4,C77
`Chr8:9216842`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B17,B65,C21,C36
`Chr8:9216859`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,B8
`Chr8:9216911`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779453.1

278 aa

139

278

MIP

PF00230 MIP 14-234 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779453.1`	Pfam	`PF00230`	MIP	Family	14	234	7.2e-76	255.6	Major intrinsic protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923470.1
CCATAGCTCTTGAACCACATCAACACAGACAATGCCGCTCGCTAGAATGACACTCGGATCTCCGGCCGAAGCCAGCCAACCCGACGCCATCAAGGCCGCCATCGCTGAGTTCATTTCTATGCCCATCTTCGTCTTCGCCGGCCAAGGCTCTGGCATGGCTTTCGCCAAGCTGACGGACGGTGGAGCAGCCACCCTGGCCGGACTTATCGCCGCGTCCATAGCGCACGCCTTCGCCCTCTTTGTGGTTGTCTCCGTTGGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998034
ATGCCGCTCGCTAGAATGACACTCGGATCTCCGGCCGAAGCCAGCCAACCCGACGCCATCAAGGCCGCCATCGCTGAGTTCATTTCTATGCCCATCTTCGTCTTCGCCGGCCAAGGCTCTGGCATGGCTTTCGCCAAGCTGACGGACGGTGGAGCAGCCACCCTGGCCGGACTTATCGCCGCGTCCATAGCGCACGCCTTCGCCCTCTTTGTGGTTGTCTCCGTTGGCGCCAACATATCGGGTGGCCACGTCAACCCCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779453.1
MPLARMTLGSPAEASQPDAIKAAIAEFISMPIFVFAGQGSGMAFAKLTDGGAATLAGLIAASIAHAFALFVVVSVGANISGGHVNPAVTFGAFIGGHISLFRGILYWIAQLLGSVVACLLLNFATDGLETSAFALSAGVSEWNAVIFEIVMTFGLVYTVYATAVDPKKGDIGTIAPITIGLIVGANILVGGAFDGTSMNPAVSFGPAVVSWTWNSHWVYWLGPLVGAAIAALVYELLFINQSGHDQLPTTDYANKFIFTT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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