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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001164`

染色体: Chr08 坐标: 9299590-9300165 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001164`
名称	SmilChr08G001164
描述	RING-H2 finger protein ATL52-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	9299590 - 9300165 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998036`
GeneID	`130998036`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998036`
原始查询	`LOC130998036`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RING-H2 finger protein ATL52-like
产物	RING-H2 finger protein ATL52-like
Arabidopsis	`AT5G43420` (AT5G43420) RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834362] identity=35.7; qcov=0.806; evalue=1.66e-24; confidence=medium
Rice	`Os02g0692000` - identity=36.6; qcov=0.743; evalue=3.52e-26; confidence=medium
GO	GO:0016567 (protein ubiquitination); GO:0016740 (transferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00097 (zf-C3HC4); PF13639 (zf-RING_2); PF13923 (zf-C3HC4_2); PF17123 (zf-RING_11)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998036

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endosome	内体	0.60000	`XP_057779454.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057779454.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.40000	`XP_057779454.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057779454.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779454.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:9299743`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B45,B90,B92
`Chr8:9299750`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D4
`Chr8:9299750`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D4
`Chr8:9299791`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,C8
`Chr8:9299872`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779454.1

191 aa

191

zf-RING_11

zf-C3HC4_2

zf-RING_2

zf-C3HC4

PF17123 zf-RING_11 102-131 aa PF13923 zf-C3HC4_2 102-144 aa PF13639 zf-RING_2 102-145 aa PF00097 zf-C3HC4 103-144 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779454.1`	Pfam	`PF17123`	zf-RING_11	Domain	102	131	7.1e-10	39.1	RING-like zinc finger
`XP_057779454.1`	Pfam	`PF13923`	zf-C3HC4_2	Domain	102	144	5.1e-09	36.5	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)
`XP_057779454.1`	Pfam	`PF13639`	zf-RING_2	Domain	102	145	1.1e-13	51.8	Ring finger domain
`XP_057779454.1`	Pfam	`PF00097`	zf-C3HC4	Domain	103	144	1.9e-05	25.1	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923471.1
ATGTCGGCATCCCCGACAGCGTCTCCGGGTGAGGATTCTTCAAAGTGGGATCCTCAGGTGATCGGCATGGTTGGCCTGGTTTGCAGCATCTTCCTGTTGTTCAGCTACTATAAGATACTAGAAAGGAACTGCGCCACAATTCGCGTATCACGAAATCGAGAGCAACGGAGGCGCCTGAATCAGCATCTTGAGGATTTCTCCTCCCAGCTCCAGAGCAGGGGACTGGACTCGTATCTCATGCACTCGCTTCCCATCACTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998036
ATGTCGGCATCCCCGACAGCGTCTCCGGGTGAGGATTCTTCAAAGTGGGATCCTCAGGTGATCGGCATGGTTGGCCTGGTTTGCAGCATCTTCCTGTTGTTCAGCTACTATAAGATACTAGAAAGGAACTGCGCCACAATTCGCGTATCACGAAATCGAGAGCAACGGAGGCGCCTGAATCAGCATCTTGAGGATTTCTCCTCCCAGCTCCAGAGCAGGGGACTGGACTCGTATCTCATGCACTCGCTTCCCATCACTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779454.1
MSASPTASPGEDSSKWDPQVIGMVGLVCSIFLLFSYYKILERNCATIRVSRNREQRRRLNQHLEDFSSQLQSRGLDSYLMHSLPITQIKKCKDTEPNLSSWECAVCLGEFEQGEWVKHLPICSHVFHVSCIDTWFQTHDSCPLCRSYVCHPNTPPQSSININIYLQTLNREDFHRHTSQHYQERRDDLSNS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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