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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001251`

染色体: Chr08 坐标: 9927765-9936599 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001251`
名称	SmilChr08G001251
描述	endo-1,4-beta-xylanase 5-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	9927765 - 9936599 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998046`
GeneID	`130998046`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998046`
原始查询	`LOC130998046`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	endo-1,4-beta-xylanase 5-like
产物	endo-1%2C4-beta-xylanase 5-like
Arabidopsis	`AT4G33840` (AT4G33840) Glycosyl hydrolase family 10 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829526] identity=51.9; qcov=0.781; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0201901` - identity=49.6; qcov=0.778; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004553 (hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF00331 (Glyco_hydro_10); PF02018 (CBM_4_9)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998046

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057779465.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057779465.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057779465.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779465.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779465.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:9927913`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:9927987`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B74,C73,D4
`Chr8:9928126`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B55,B76,C22,C37,C71
`Chr8:9928129`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B55,B76,C22,C37,C71
`Chr8:9928161`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B55,B76,C22,C37,C71
`Chr8:9928325`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B121,C37,C71
`Chr8:9928325`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B121,C37,C71
`Chr8:9928559`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B121,B55,C37,C71
`Chr8:9928564`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B121,B55,C37,C71
`Chr8:9928594`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B15,B23,C1
`Chr8:9928644`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B110,B99,C3,C6
`Chr8:9928655`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B53,C46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779465.1

676 aa

338

676

CBM_4_9

Glyco_hydro_10

PF02018 CBM_4_9 151-264 aa PF00331 Glyco_hydro_10 330-584 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779465.1`	Pfam	`PF02018`	CBM_4_9	Domain	151	264	5e-06	27.7	Carbohydrate binding domain
`XP_057779465.1`	Pfam	`PF00331`	Glyco_hydro_10	Domain	330	584	2.6e-36	126.2	Glycosyl hydrolase family 10

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923482.1
ATGTTTCGAGCCCAACCCCTCGACGAGCTCGCAAAAGCTTTGGCTGAAGAATCCATCGATAAACGGCAGGTTGCGTGGCCTCTCGGCTTCCGATCTCCTCGGGTAGAACTCGCAGCTGAACTGGCGGCGGCCGCCGACGATGATAAGTCGATCGTCGGGGAGGATGTGGTTGGTGGCGTACCAGCAGCGCAGGGCGAGGGCAGGGTTGATCTCCTGCCAGTCGTAGGAGGCGTCAGCGGCAGCGTAGGGCTTGTAGAGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998046
ATGTTTCGAGCCCAACCCCTCGACGAGCTCGCAAAAGCTTTGGCTGAAGAATCCATCGATAAACGGCAGGTTGCGTGGCCTCTCGGCTTCCGATCTCCTCGGGTAGAACTCGCAGCTGAACTGGCGGCGGCCGCCGACGATGATAAGTCGATCGTCGGGGAGGATGTGGTTGGTGGCGTACCAGCAGCGCAGGGCGAGGGCAGGGTTGATCTCCTGCCAGTCGTAGGAGGCGTCAGCGGCAGCGTAGGGCTTGTAGAGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779465.1
MFRAQPLDELAKALAEESIDKRQVAWPLGFRSPRVELAAELAAAADDDKSIVGEDVVGGVPAAQGEGRVDLLPVVGGVSGSVGLVESGGAIAVVVIVGLEDGAVWEDGGGGAPGVGRSDLILFEANAVPYDYTYTAECLARPLEAQYSGGVVVNPELNEGLKGWSSFGNSKXEHAQSNDGNKYIVASTRNLPFHTFSQTFHLDKEKLYTFSAWFQVSHGKADIAAIFKAKSSYITAGWVTAQSGCWSMLKGGIVVNASAP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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