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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001289`

染色体: Chr08 坐标: 10271862-10272635 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001289`
名称	SmilChr08G001289
描述	uncharacterized SmilChr08G001289
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	10271862 - 10272635 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998048`
GeneID	`130998048`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998048`
原始查询	`LOC130998048`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Plant basic secretory protein (BSP) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816001]; symbol=AT2G15130; hit=AT2G15130; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Plant basic secretory protein (BSP) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816001]; symbol=AT2G15130; hit=AT2G15130; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G15130` (AT2G15130) Plant basic secretory protein (BSP) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816001] identity=37.3; qcov=0.875; evalue=4.99e-46; confidence=medium
Rice	`Os10g0490900` - identity=38.5; qcov=0.747; evalue=2.09e-40; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04450 (BSP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998048

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057779467.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779467.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779467.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779467.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779467.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:10271875`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	20	A10,A3,A7,B123,B124,B125,B135,B14,B26,B4,B40,B44,B55,B74,B97,C2,C33,C38,C50,C9
`Chr8:10271988`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr8:10272014`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B115,C31
`Chr8:10272034`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,B67,B7,C82
`Chr8:10272054`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,C62
`Chr8:10272056`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,C49
`Chr8:10272088`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	99	A1,A13,A16,A19,A21,A23,A24,A6,A8,A9,B1,B10,B100,B101,B106,B109,B111,B113,B117,B12,B121,B127,B128,B129,B131,B132,B134,B138,B15,B21,B23,B28,B29,B33,B36,B38,B39,B47,B48,B49,B50,B52,B56,B60,B65,B7,B71,B72,B73,B79,B80,B82,B86,B88,B90,B92,B95,B96,B97,C1,C10,C11,C16,C18,C22,C25,C26,C27,C33,C39,C4,C40,C41,C48,C54,C56,C58,C59,C6,C60,C62,C63,C64,C66,C67,C69,C70,C71,C72,C73,C74,C8,C80,C84,C85,C86,D3,D5,D6
`Chr8:10272142`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:10272329`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr8:10272332`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,A7,B75,C50,C70
`Chr8:10272579`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B53
`Chr8:10272579`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779467.1

257 aa

128

257

BSP

PF04450 BSP 35-234 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779467.1`	Pfam	`PF04450`	BSP	Family	35	234	8.9e-41	140.7	Peptidase of plants and bacteria

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923484.1
ATGCAAGCAAAAGAATATATAAGAACTGATATATCAAGCATGAAGACGAAACAGCTCTTAATCTTAATCTGTGTCGTCGCCGTCCACCGCATCGACGCAACCAAATACGTGGTGACGAACACGGTCCCACACACCCCCGGCGGGAAGTTTTTCGACCAAGAGCTGGGCGTCCGCTACACCCTTGGACTGATGCCCATCCTCAACAGAGACATCTTTTACATCCTGAAAGAGCGATACTCCTGGGAGCAGCGCAACGTGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998048
ATGCAAGCAAAAGAATATATAAGAACTGATATATCAAGCATGAAGACGAAACAGCTCTTAATCTTAATCTGTGTCGTCGCCGTCCACCGCATCGACGCAACCAAATACGTGGTGACGAACACGGTCCCACACACCCCCGGCGGGAAGTTTTTCGACCAAGAGCTGGGCGTCCGCTACACCCTTGGACTGATGCCCATCCTCAACAGAGACATCTTTTACATCCTGAAAGAGCGATACTCCTGGGAGCAGCGCAACGTGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779467.1
MQAKEYIRTDISSMKTKQLLILICVVAVHRIDATKYVVTNTVPHTPGGKFFDQELGVRYTLGLMPILNRDIFYILKERYSWEQRNVPVLNVYISEFPGYAYKNGNNINISASALDNFYYPRNKSKLFFSMMLIHEMTHVFQWHGNFGAPGGLTEGTADYVMVKSGIYEEDKYTKPGAGKRWDQGYGVTERFLEYCDGLVEDFTVKLNKMMRYKYSDSYWVELLGKPVDQVWTDYKAKYGNMPQTQNYSIGTFQGLEY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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