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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001346`

染色体: Chr08 坐标: 10765786-10767087 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001346`
名称	SmilChr08G001346
描述	uncharacterized SmilChr08G001346
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	10765786 - 10767087 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998059`
GeneID	`130998059`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998059`
原始查询	`LOC130998059`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=33; qcov=0.803; evalue=5.62e-35; confidence=low
Rice	`Os01g0872900` - identity=48.5; qcov=0.652; evalue=8.35e-67; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998059

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779478.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057779478.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057779478.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057779478.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779478.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:10765788`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B44,B99,C39
`Chr8:10765808`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr8:10765817`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr8:10765831`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr8:10765833`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:10765838`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C34
`Chr8:10765849`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C82
`Chr8:10765867`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	17	A13,A23,A4,B118,B13,B138,B139,B140,B36,B44,B78,B84,B88,B99,C39,C49,C75
`Chr8:10765879`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B140,C82
`Chr8:10765879`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B140,C82
`Chr8:10765890`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr8:10765894`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B44,B99,C39

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779478.1

351 aa

176

351

DUF8418

Plant_tran

DDE_Tnp_4

PF28509 DUF8418 57-95 aa PF04827 Plant_tran 119-284 aa PF13359 DDE_Tnp_4 137-276 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779478.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	57	95	5.2e-19	68.4	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057779478.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	119	284	1.1e-63	215.3	Plant transposon protein
`XP_057779478.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	137	276	6.4e-10	39.6	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923495.1
ATGGAATGGTTTGATGATACTTCGTCGTCTTCCTCCGACGAGGTAGCGCAGGCGATCATCGATGAGATCCAGGAGCACAAACAATTGCTTGCTCAAATGTACTACCAACTGGCGCTGGAACATGTTGTTCATCACCGACAATACGTCCACTGTGATCGTGAGGCTGCCCATTTACGTCTTATACAAGACTACTTCAACGACAATCCGACGTACGAGCCTACATTTTTTCGACGTCGTTTTCAGATGCAGAAGGAGTTGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998059
ATGGAATGGTTTGATGATACTTCGTCGTCTTCCTCCGACGAGGTAGCGCAGGCGATCATCGATGAGATCCAGGAGCACAAACAATTGCTTGCTCAAATGTACTACCAACTGGCGCTGGAACATGTTGTTCATCACCGACAATACGTCCACTGTGATCGTGAGGCTGCCCATTTACGTCTTATACAAGACTACTTCAACGACAATCCGACGTACGAGCCTACATTTTTTCGACGTCGTTTTCAGATGCAGAAGGAGTTGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779478.1
MEWFDDTSSSSSDEVAQAIIDEIQEHKQLLAQMYYQLALEHVVHHRQYVHCDREAAHLRLIQDYFNDNPTYEPTFFRRRFQMQKELFLRIVEAVQGGDTYFQMSHDARGRDFLTPLQKCTNFPKAWHDAYTCGDQEEPTLILEAVASHNLWILHAFFGVAGSNNDINILNQSPLFSDVLDGTATPVLFEANQRYCQMSYYLCDGIYPEWRCFVKSPLMATNPKEARFKKVQELTQKDVERAFGVFQARWRIIRSPARGWY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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