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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003932`

染色体: Chr01 坐标: 57602491-57604136 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003932`
名称	SmilChr01G003932
描述	uncharacterized SmilChr01G003932
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	57602491 - 57604136 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998076`
GeneID	`130998076`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998076`
原始查询	`LOC130998076`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Putative membrane lipoprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827417]; symbol=EDA8; hit=AT4G00310; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Putative membrane lipoprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827417]; symbol=EDA8; hit=AT4G00310; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G00310` (EDA8) Putative membrane lipoprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827417] identity=35.5; qcov=0.521; evalue=2.53e-11; confidence=low
Rice	`Os02g0487300` (OsEnS-37) - identity=35.8; qcov=0.306; evalue=2.16e-06; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF08879 (WRC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998076

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779495.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779495.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779495.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779495.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057779495.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:57602880`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B67,C21
`Chr1:57602987`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr1:57603011`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr1:57603057`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B101,B24,B82
`Chr1:57603074`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,C53
`Chr1:57603242`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,B61
`Chr1:57603258`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B38
`Chr1:57603258`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B38
`Chr1:57603971`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr1:57603982`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779495.1

265 aa

132

265

WRC

PF08879 WRC 110-143 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779495.1`	Pfam	`PF08879`	WRC	Domain	110	143	1.5e-10	41.3	WRC

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923512.1
AGAGGGAAAAAACAGTAATAAGAAAAACAAAAGCAAATTTTGGATCTACTTCATCGTGCTCAACGGCCCCTCGCCCCCCTCCCTCAAACTTCTCCGCCCCCCCGCCCCCGCCCCCGCCATGAGAATACGCAAGCACGCCAAGATTTCTCCACTGCTCTACGCGTCGTCGTCTCTCAAGGCCGGCCCCCTCCTCCAAACTCATGTCTGCCAGCTCAATCAGTCGCCGTGGGACGTCATGACCTTCTCGCCACCGTCGTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998076
ATGAGAATACGCAAGCACGCCAAGATTTCTCCACTGCTCTACGCGTCGTCGTCTCTCAAGGCCGGCCCCCTCCTCCAAACTCATGTCTGCCAGCTCAATCAGTCGCCGTGGGACGTCATGACCTTCTCGCCACCGTCGTCTCCTCCTCCGCCGTTTCAGATGAACGGGAGGGATGCTCCTGCTGAAAATGGGAGCTCCGACCACCGCGTTTCAGTTGCTGAGAGGGAGCTTACGAGATCAGAATATCCGATCTCCACGCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779495.1
MRIRKHAKISPLLYASSSLKAGPLLQTHVCQLNQSPWDVMTFSPPSSPPPPFQMNGRDAPAENGSSDHRVSVAERELTRSEYPISTRKVEAADEDTPPPPVENEATIIYCCKTDGKSWQCRREAAEGNSLCEHHLSLVKSYNTNVAHNHAARKSVKPAAAEASRRPRPKKAPAASSSNPYEFYYYSGFGPRWGKRRGETDRKNSNGMPKNVEMQPVMIPSIGDEDFIFEDEDEDEDEEDEGEEARNNGKKRMRKPIKARS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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