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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001505`

染色体: Chr08 坐标: 12192044-12194355 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001505`
名称	SmilChr08G001505
描述	uncharacterized SmilChr08G001505
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	12192044 - 12194355 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998083`
GeneID	`130998083`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998083`
原始查询	`LOC130998083`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OSJNBa0010D22.24; symbol=OSJNBa0010D22.24; hit=Os03g0586600; species=rice; confidence=weak
产物	OSJNBa0010D22.24; symbol=OSJNBa0010D22.24; hit=Os03g0586600; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT5G51940` (NRPB6A) RNA polymerase Rpb6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835269] identity=80; qcov=0.246; evalue=1.16e-22; confidence=weak
Rice	`Os03g0586600` (OSJNBa0010D22.24) - identity=78.7; qcov=0.272; evalue=3.53e-25; confidence=weak
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003899 (DNA-directed RNA polymerase activity); GO:0005665 (RNA polymerase II, core complex); GO:0005666 (RNA polymerase III complex); GO:0005736 (RNA polymerase I complex); GO:0006351 (DNA-templated transcription)
KEGG	smil03020 (RNA polymerase - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03420 (Nucleotide excision repair - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01192 (RNA_pol_Rpb6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998083

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057779499.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057779499.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057779499.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779499.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779499.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:12193245`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	16	A13,A21,B108,B119,B22,B53,B64,B68,B70,B71,B88,C10,C18,C38,C70,D11
`Chr8:12193697`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	19	A10,A18,A2,B106,B115,B119,B130,B140,B42,B43,B47,B60,B75,B82,B84,B85,C19,C45,C60
`Chr8:12193716`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B114
`Chr8:12193716`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B114
`Chr8:12193720`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A11,B94,C12
`Chr8:12193720`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A11,B94,C12
`Chr8:12193729`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr8:12193748`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B137,B5
`Chr8:12193750`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B115
`Chr8:12194094`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B21,C49
`Chr8:12194104`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B86,C68,C70,D1
`Chr8:12194107`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	B100,B117,B27,B48,B61,B69,B95,C78,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779499.1

224 aa

112

224

RNA_pol_Rpb6

PF01192 RNA_pol_Rpb6 170-206 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779499.1`	Pfam	`PF01192`	RNA_pol_Rpb6	Family	170	206	2.9e-06	27.9	RNA polymerase Rpb6

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923516.1
ATGGGGCTAGGGCTCGGCCTTCTACCCTCGTCAGTGTGTGGGCGAGTGGTTGGAGGCTCCGCAGCAGAGTCCGACAGGAGCGACAGCATTGATGGAAGAAATCGACATCTCCGCCGCCCTACAAACCAGAGAAGGGGTATGGGTGGAAGAAATCGAAATCTCTGGCCACTAAAACCAGATCCGCCGCGCCTGCATACCCTAGCCCCAAGATCCGCCGGAGAAGAGGGGTATGGGTGGTGGCTGTTCGACCGGAGAAGGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998083
ATGGGGCTAGGGCTCGGCCTTCTACCCTCGTCAGTGTGTGGGCGAGTGGTTGGAGGCTCCGCAGCAGAGTCCGACAGGAGCGACAGCATTGATGGAAGAAATCGACATCTCCGCCGCCCTACAAACCAGAGAAGGGGTATGGGTGGAAGAAATCGAAATCTCTGGCCACTAAAACCAGATCCGCCGCGCCTGCATACCCTAGCCCCAAGATCCGCCGGAGAAGAGGGGTATGGGTGGTGGCTGTTCGACCGGAGAAGGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779499.1
MGLGLGLLPSSVCGRVVGGSAAESDRSDSIDGRNRHLRRPTNQRRGMGGRNRNLWPLKPDPPRLHTLAPRSAGEEGYGWWLFDRRRLVDAESVSSIHSPCPLIKTFLPFHDFCATFPPEPPSTEAAVNQSHREGAEIEEDNNAAEEIPDAVEGEGDEKQDQEAVERPQKTSKYMTKYERARILGARALQISMNAPVMVELEGETDPLESRGMRRVICTAMWLRM

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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