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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001755`

染色体: Chr08 坐标: 14762975-14764071 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001755`
名称	SmilChr08G001755
描述	probable pectinesterase 29
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	14762975 - 14764071 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998110`
GeneID	`130998110`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998110`
原始查询	`LOC130998110`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable pectinesterase 29
产物	probable pectinesterase 29
Arabidopsis	`AT3G24130` (AT3G24130) Pectin lyase-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821999] identity=53.2; qcov=0.974; evalue=3.55e-114; confidence=high
Rice	`Os07g0655600` (OsPME21) - identity=45.3; qcov=0.858; evalue=2.97e-71; confidence=high
GO	GO:0030599 (pectinesterase activity); GO:0042545 (cell wall modification)
KEGG	-
Pfam	PF01095 (Pectinesterase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998110

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057779528.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057779528.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057779528.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779528.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779528.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:14762994`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr8:14763010`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B110
`Chr8:14763094`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr8:14763493`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr8:14763816`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B108,B113,B78
`Chr8:14763982`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779528.1

309 aa

154

309

Pectinesterase

PF01095 Pectinesterase 10-295 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779528.1`	Pfam	`PF01095`	Pectinesterase	Repeat	10	295	1.4e-64	218.5	Pectinesterase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923545.1
ATGCAACTAGTGTCTAAGACGATCTCCGTTGATCCGTTGGGGAGAGGCGGTTTCAGAAGCATCCAGGCAGCCATTAACTCCGTGCCTTCAAACAACAAGATATGGATTCAAATAAACATCGGAAGAGGCGTGTATAGGGAAAAGGTTAAAATACCTTCGGACAAGCCGTACATCTACCTTAAAGGAGCAGGAATGACAAACACAGTGATAGAGTGGAATGATCATGGCTCCATTGACACGAGCCCGACTTTCGATTCTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998110
ATGCAACTAGTGTCTAAGACGATCTCCGTTGATCCGTTGGGGAGAGGCGGTTTCAGAAGCATCCAGGCAGCCATTAACTCCGTGCCTTCAAACAACAAGATATGGATTCAAATAAACATCGGAAGAGGCGTGTATAGGGAAAAGGTTAAAATACCTTCGGACAAGCCGTACATCTACCTTAAAGGAGCAGGAATGACAAACACAGTGATAGAGTGGAATGATCATGGCTCCATTGACACGAGCCCGACTTTCGATTCTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779528.1
MQLVSKTISVDPLGRGGFRSIQAAINSVPSNNKIWIQINIGRGVYREKVKIPSDKPYIYLKGAGMTNTVIEWNDHGSIDTSPTFDSQAHHTIARGIKFVNSYNSPPNGNRNPVERAVAARIQGDKSALYECGFFGLQDTLWDVEGRHYYKNCMIEGAIDFIFGTAQSLYEGCSISVAAGGLKGSKGYITAQGRVNPGDSNGFVFKQCKIFGSGQAFLGRPWRNYARVVFYETQMSEVVVPQGWYIWNSGGHEGQLTLSEY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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