当前解析结果
SmilChr08G002002| 统一新 Gene ID | SmilChr08G002002 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G002002 |
| 描述 | histone H4-like |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 17793020 - 17794511 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130998143 |
|---|---|
| GeneID | 130998143 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130998143 |
| 原始查询 | LOC130998143 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | histone H4-like |
| 产物 | histone H4-like |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | GO:0000786 (nucleosome); GO:0003677 (DNA binding); GO:0030527 (structural constituent of chromatin); GO:0046982 (protein heterodimerization activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130998143 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057779560.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057779560.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057779560.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057779560.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057779560.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:17793032 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C84 |
Chr8:17794028 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B13,B26,B37,C77,D11 |
Chr8:17794033 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B12,C14 |
Chr8:17794044 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B23 |
Chr8:17794052 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B12,C14 |
Chr8:17794083 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B23 |
Chr8:17794084 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B122 |
Chr8:17794095 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C40 |
Chr8:17794107 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C12 |
Chr8:17794126 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B1,B24,C85 |
Chr8:17794153 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B133,D10 |
Chr8:17794166 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B1,B24 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。