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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003941`

染色体: Chr01 坐标: 57746928-57753052 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003941`
名称	SmilChr01G003941
描述	protein MRG1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	57746928 - 57753052 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998145`
GeneID	`130998145`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998145`
原始查询	`LOC130998145`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein MRG1-like
产物	protein MRG1-like
Arabidopsis	`AT4G37280` (AT4G37280) MRG family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829882] identity=51.9; qcov=0.907; evalue=2.99e-100; confidence=high
Rice	`Os11g0545600` (MRG702) - identity=49.5; qcov=0.895; evalue=1.26e-90; confidence=high
GO	GO:0000123 (histone acetyltransferase complex); GO:0005634 (nucleus); GO:0006325 (chromatin organization); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0016573 (GO:0016573)
KEGG	smil03082 (ATP-dependent chromatin remodeling - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF05712 (MRG); PF11717 (Tudor-knot); PF22732 (MSL3_chromo-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998145

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779562.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057779562.1`
3	Nuclear body	核内小体	0.40000	`XP_057779562.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779562.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779562.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:57747197`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B18,B31,B34,C71,D6
`Chr1:57749552`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,A5
`Chr1:57749753`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr1:57751239`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,B68
`Chr1:57751273`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr1:57751300`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:57752819`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr1:57752851`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779562.1

323 aa

162

323

Tudor-knot

MSL3_chromo-like

MRG

PF11717 Tudor-knot 43-92 aa PF22732 MSL3_chromo-like 43-108 aa PF05712 MRG 138-309 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779562.1`	Pfam	`PF11717`	Tudor-knot	Family	43	92	3.3e-09	37.2	RNA binding activity-knot of a chromodomain
`XP_057779562.1`	Pfam	`PF22732`	MSL3_chromo-like	Domain	43	108	7.2e-13	49.1	MSL3 chromodomain-like
`XP_057779562.1`	Pfam	`PF05712`	MRG	Family	138	309	3.2e-46	157.8	MRG

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923579.1
ACGATAAAGAAAAGCAATAAGTTTATTGATCAAAATGATTACGCTGTTCGTGCTTCATTCCAGGTGCCCATCCGACACATACAAAGAAAAGAATTCACCTTTTTAATAATCATAAAATAAATACTTCTGGAGACTTTCCCCTTGTAAGTGACACTGGCTAACATAAATTGACGAAAAATTATAAAAAAAAAAAAAAAAATGAGCAACTCTGGAGCTATAGAAAGCTACACCACCCCAATCTCCGGCGGCTGCGGCGACGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998145
ATGAGCAACTCTGGAGCTATAGAAAGCTACACCACCCCAATCTCCGGCGGCTGCGGCGACGGCGGTGGCACCACCAGCAGCGTCACCGATAGTCCGATTAGGGACGAAGCCGTTGATTCAAGCCCTTTTCAAGAAGGTGAAAAAGTCCTCGCATTTCATGGCCCCTGCCTCTACGACGCCAAGGTGCAAAAGATTGAATCTTGTTCTAAGGGATGGAAGTATTATGTTCATTATCCTGGATGGAGCAAAAAGTGGGATGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779562.1
MSNSGAIESYTTPISGGCGDGGGTTSSVTDSPIRDEAVDSSPFQEGEKVLAFHGPCLYDAKVQKIESCSKGWKYYVHYPGWSKKWDVWKGVTDLLKHTEANIQKKKELMVKHSGDKNTRLGRPLHVETRSSTGVRGRKRKHETIKKEVSFVPSEKHVNLQIPSTLKKQLVVDHECITHLGQLVKLPRSPSAYEILNKYFDYQVKKDGMIMETVKEIVDGLRCYFDKALPAMLLYKEERQQYKEVISDNVSPSGVYGAEHL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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