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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002029`

染色体: Chr08 坐标: 18083981-18084932 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002029`
名称	SmilChr08G002029
描述	uncharacterized SmilChr08G002029
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	18083981 - 18084932 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998149`
GeneID	`130998149`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998149`
原始查询	`LOC130998149`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861]; symbol=AT2G13770; hit=AT2G13770; species=arabidopsis; confidence=low
产物	nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861]; symbol=AT2G13770; hit=AT2G13770; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=32.8; qcov=0.676; evalue=2.72e-16; confidence=low
Rice	`Os01g0872900` - identity=55; qcov=0.341; evalue=2.02e-15; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998149

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779565.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057779565.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057779565.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779565.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779565.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:18084009`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr8:18084013`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr8:18084017`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr8:18084028`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	C15,C58
`Chr8:18084028`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C15,C58
`Chr8:18084082`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B24,B68
`Chr8:18084097`	`GAC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	21	A19,B101,B102,B111,B12,B127,B19,B2,B35,B51,B77,B82,B83,B84,C1,C42,C46,C48,C58,D1,D8
`Chr8:18084101`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	19	A19,B101,B102,B111,B12,B127,B19,B2,B35,B51,B77,B82,B84,C1,C42,C46,C48,D1,D8
`Chr8:18084103`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	20	A19,B101,B102,B111,B12,B127,B19,B2,B35,B51,B77,B82,B84,C1,C42,C46,C48,C58,D1,D8
`Chr8:18084105`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B6
`Chr8:18084112`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C8
`Chr8:18084112`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779565.1

176 aa

176

Plant_tran

PF04827 Plant_tran 63-119 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779565.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	63	119	4.3e-17	63.1	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923582.1
ATGAGCCATGATGCACGAGGTCGGGACTCTCTCACGCCTTTGCAGATATGCACGGTGGCTATCCGCCAATTAGCCACTGGCGTCAGTGCGGATACTTTCGATGAGTATCTCAAGGTCGCCGACACGATAGGGCATCTATGCCTCAAGAGATTCTGCAAGACTGTCATCCGGACTTACGAAACCGATGTCGCCGGTTCAAATAACGACATCAACGTTCTGAACCAGTCGTCTCTGTTCTCCGACGTGTTGGATGGAACGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998149
ATGAGCCATGATGCACGAGGTCGGGACTCTCTCACGCCTTTGCAGATATGCACGGTGGCTATCCGCCAATTAGCCACTGGCGTCAGTGCGGATACTTTCGATGAGTATCTCAAGGTCGCCGACACGATAGGGCATCTATGCCTCAAGAGATTCTGCAAGACTGTCATCCGGACTTACGAAACCGATGTCGCCGGTTCAAATAACGACATCAACGTTCTGAACCAGTCGTCTCTGTTCTCCGACGTGTTGGATGGAACGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779565.1
MSHDARGRDSLTPLQICTVAIRQLATGVSADTFDEYLKVADTIGHLCLKRFCKTVIRTYETDVAGSNNDINVLNQSSLFSDVLDGTMTPMIFETNQRYYQMGYYLCDDICPEWRCFLKSPPMVKELPIREMKTQDTGCLAVTRRRVLEQPRFASRNTCKEMQFSEIDRYMLNSNMI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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