当前解析结果
SmilChr08G002082| 统一新 Gene ID | SmilChr08G002082 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G002082 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G002082 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 18712436 - 18712882 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130998155 |
|---|---|
| GeneID | 130998155 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130998155 |
| 原始查询 | LOC130998155 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840410]; symbol=AT1G35210; hit=AT1G35210; species=arabidopsis; confidence=low |
| 产物 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840410]; symbol=AT1G35210; hit=AT1G35210; species=arabidopsis; confidence=low |
| Arabidopsis | AT1G35210 (AT1G35210)uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840410] identity=62.2; qcov=0.304; evalue=5.67e-12; confidence=low |
| Rice | Os06g0218800- identity=29.7; qcov=0.932; evalue=1.34e-07; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF05340 (DUF740) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130998155 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057779571.1 |
| 2 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.60000 | XP_057779571.1 |
| 3 | Cytoskeleton | 细胞骨架 | 0.20000 | XP_057779571.1 |
| 4 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057779571.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057779571.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:18712881 |
A |
AT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 3 | A24,C71,D4 |
Chr8:18712881 |
A |
AT |
1bp_insertion | CDS_variant | 3 | A24,C71,D4 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057779571.1PF05340
DUF740 11-82 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057779571.1 |
Pfam | PF05340 |
DUF740 | Family | 11 | 82 | 2e-05 | 24.3 | Protein of unknown function (DUF740) |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。